Первый выпуск командиров для ГМЧ (195 человек из числа переподготовленных) из училища состоялся 3 января 1942 года. В дальнейшем, в течение января — апреля того же года, 1-е ГКМАУ произвело еще четыре выпуска переподготовленных курсантов (всего 697 человек). Лейтенанты и младшие воентехники, последующие семь выпусков 1942 года проходили обучение в 1-е ГКМАУ уже по шестимесячной программе.
Приказом СВГК № 0086 от 8 мая 1942 года к 15 мая в Москве был формирован дивизион резерва командного состава (штат № 08/59) численностью в 700 человек. С этого времени личный состав, прибывающий из отделов кадров родов войск и окончивший училища и курсы усовершенствования ГМЧ, направлялся через отдел кадров штаба командующего ГМЧ в дивизион резерва, куда перенесла свою работу комиссия ЦК ВКП(б). В дивизионе резерва отобранные комиссией занимались боевой подготовкой, и по мере надобности направлялись в части.
Формирование большого количества частей и соединений в течение первой половины 1942 года потребовало и большого количества среднего командно-начальствующего состава для них. Приказом НКО СССР № 0575 от 26 июля 1942 года Омское минометное училище с 1 августа реорганизовывалось в «Омское артиллерийско-минометное училище» с подчинением командующему ГМЧ СВГК и содержанием по штату № 19/85, численностью 1600 курсантов. Следующим приказом НКО СССР № 00244 от 26 ноября 1942 года училище переименовывалось во «2-ое гвардейское минометно-артиллерийское училище» (2-е ГМАУ).
Осенью 1942 года срок обучения в обоих училищах был увеличен с шести до восьми месяцев. Постановлением ГОКО № ГОКО-4286сс от 8 октября 1943 года «О реорганизации военных училищ Красной Армии» сокращалась штатная численность обоих гвардейских минометных училищ с 900 до 600 человек переменного состава в каждом. Срок обучения в них устанавливался 1,5 года. В октябре 1944 года срок обучения был вновь уменьшен до 12 месяцев, а в 1945 году снова увеличен до 18 месяцев.
Для ускоренной подготовки и создания резерва командиров батарей, дивизионов, полков, начальников их штабов и заместителей командиров батарей и дивизионов по политической части, а также для переподготовки командиров взводов при обоих училищах ГМЧ были организованы трех-, четырех-и шестимесячные курсы усовершенствования офицерского состава. Длительность срока обучения зависела от профиля подготовки и состояния знаний слушателей при приеме. С начала 1943 года подготовка командиров дивизионов и полков проводилась также в Высшей офицерской артиллерийской школе, а подготовка начальников штабов полков и бригад — в Высшей офицерской артиллерийской штабной школе. В 1-м ГКМАУ курсы начали действовать уже с 1 декабря 1941 года, одновременно с переходом всего училища на новые программы подготовки командиров взводов для ГМЧ из курсантов, ранее обучавшихся по программам училищ корпусной артиллерии. Первый (ускоренный) выпуск курсы произвели в январе 1942 года. В дальнейшем на курсах усовершенствования была развернута сначала шестимесячная, а потом восьмимесячная переподготовка офицеров — командиров взводов, срок которой в 1944 году был доведен до одного года. В 1943–1944 годах курсы усовершенствования действовали и при 2-м ГМАУ.
Политическими работниками формировавшиеся части комплектовались из числа политработников, выделявшихся Политическим управлением Московского военного округа и Главным политическим управлением Красной Армии. Командно-начальствующий состав административно-хозяйственной, артиллерийско-технической, автотехнической, медицинской и других служб выделялся управлениями кадров соответствующих родов войск и служб.
В 1941–1943 годах остро ощущался острый недостаток в инженерах и техниках автомобильной службы и в артиллерийских техниках для ГМЧ. Поэтому в 1942 году при 2-й ГМАУ были созданы специальные трех-, четырехмесячные курсы для подготовки автотехников и артиллерийских техников-электриков из числа командиров, имевших некоторые знания и опыт в этих специальностях. В 1-м ГМКМАУ был введен технический дивизион курсантов в составе батареи артиллерийской инструментальной разведки (АИР), артиллерийской технической батареи и автотехнической батареи.
С целью подготовки высококвалифицированных инженерных кадров для военной приемки и органов артиллерийского снабжения в 1944 году при Артиллерийской академии им. Дзержинского на факультете боеприпасов было создано специальное отделение реактивного вооружения из 12 слушателей, развернутое в 1945 году в факультет реактивного вооружения. Факультет был укомплектован слушателями отделения и студентами старших курсов гражданских ВУЗов (1-й курс — 47 слушателей, 2-й курс — 36, 3-й курс — 39, 4-й курс — 36, 5-й курс — 12, всего 170 слушателей).
С начала 1943 года до конца войны в Высшей офицерской артиллерийской школе для ГМЧ было подготовлено 23 командира дивизиона и 14 командиров полков, в Высшей офицерской артиллерийской штабной школе — 21 начальник штаба полка и 21 начальник штаба бригады.