В годы Великой Отечественной войны при подготовке боевых действий против милитаристской Японии был получен опыт в организации и осуществлении маневра авиасоединениями РВГК с одного театра войны на другой. С целью усиления авиационной группировки на Дальнем Востоке с Западного ТВД в конце июня 1945 года и начале июля были перебазированы в 12 ВА Забайкальского фронта два бомбардировочных авиакорпуса ( 6 и 7 бах ) и 190-я истребительная авиадивизия РВГК. Экипажи бомбардировочных авиакорпусов перебазировались на Дальний Восток по воздуху на своих боевых самолетах, а летный состав 190 иад РВГК - на транспортных самолетах. Боевые самолеты 190 иад РВГК получила на месте нового базирования. Передача в состав 12 ВА двух авиакорпусов, вооружённых самолетами Ту-2 с большим радиусом действия, оказала весьма положительное влияние на ход боевых действий войск Забайкальского фронта в Маньчжурской стратегической операции. Это объясняется тем, что части авиакорпусов на самолетах Ту-2 могли даже в условиях крайней ограниченности аэродромов и стремительного продвижения войск выполнять боевые задачи в их интересах, длительное время базируясь на одних аэродромах.
Советское командование придавало большое значение правильному применению соединений РВГК, поступавших на усиление воздушных армий фронтов. 29 марта 1943 года в директиве командующего ВВС Советской Армии в адрес командующих воздушными армиями и командиров авиакорпусов указывалось: "Авиационные корпуса РВГК, придаваемые в оперативное подчинение воздушных армий, использовать только на направления главных ударов и ни в коем случае не допускать распыления их для одновременного поражения большого числа объектов и выполнения многих задач".
Помимо директивных указаний командующий ВВС Советской Армии или его заместители по существу непрерывно находились на фронтах войны в качестве представителей Ставки ВГК по авиации и принимали участие в разработке планов применения ВВС и использования авиационных соединений РВГК в крупнейших стратегических операциях.
Истребительные авиационные соединения РВГК использовались главным образом для ведения борьбы за господство в воздухе и прикрытия войск и объектов тыла фронта. Так, в Курской битве непосредственное влияние на изменение воздушной обстановки оказал ввод в сражение истребительных авиакорпусов РВГК. В первые дни вражеского наступления противник владел инициативой в воздухе. По указанию командования ВВС командиры 4-го, 5-го и 6-го истребительных авиакорпусов выехали на передовые командные пункты, расположенные у переднего края. Умело нацеливая группы истребителей на бомбардировщиков противника и своевременно наращивая силы в воздухе, они сумели добиться резкого перелома обстановки в воздухе. Противник стал нести большие потери и снизил свою активность. После ввода в сражение дополнительно еще двух истребительных авиационных дивизий РВГК в полосах Центрального и Воронежского фронтов инициатива окончательно перешла на сторону советской авиации.
В Висло-Одерской операции прикрытие главной группировки войск 1 -го Белорусского фронта успешно осуществляли 3 и 6 иак. В Берлинской операции удержание господства в воздухе и прикрытие главной группировки войск 1-го Белорусского фронта осуществлялись 3-м и 13-м истребительными авиакорпусами РВГК, которые успешно справились с поставленной задачей.
Большинство командиров истребительных авиационных соединений РВГК в ходе войны зачастую сами находились во главе боевых порядков соединения (группы самолетов), показывая пример мужества, бесстрашия и умения руководить боем в воздухе. Например, дважды Герой Советского Союза Е.Я. Савицкий (ныне маршал авиации) лично совершил 216 боевых вылетов и сбил 22 вражеских самолета, а летчики 3-го истребительного корпуса под его руководством произвели за войну около 29 тысяч боевых вылетов и уничтожили 1653 самолета противника.
Бомбардировочные и штурмовые авиационные соединения РВГК составляли главную ударную силу воздушных армий. Важнейшими задачами, возлагаемыми на штурмовые и бомбардировочные авиакорпуса, являлись авиационная поддержка войск фронтов при прорыве обороны и развитии тактического успеха в оперативный, нарушение железнодорожных к автомобильных перевозок и борьба с резервами, уничтожение группировок войск в оперативной глубине, уничтожение самолетов противника на аэродромах. Как и истребительные авиакорпуса, они использовались на направлениях главных ударов фронтов.