В 5 часов 30 минут вершина горы Высокой перешла в руки японцев. Но дальше продвинуться штурмующим не удалось - резервный отряд русских, впереди которых шли матросы-десантники с крейсера "Баян", остановил их. Генерал-майор Р.И. Кондратенко с наступлением темноты бросил в контратаку все, что мог собрать - две роты стрелков и две роты моряков, но было уже поздно. Японские пулеметчики в большом числе заняли вершину Высокой и встретили контратакующих настоящим ливнем огня. Больше резервов Кондратенко не имел. К утру следующего дня защитники Порт-Артура оставили ближние подступы к горам Высокой и Плоской.
Бой за гору Высокую стал кульминацией четвертого штурма Порт-Артура. В бою за овладение Высокой и Плоской японская осадная армия потеряла до 12 тысяч солдат и офицеров. Велики оказались и потери русских: из строя выбыли 4500 человек, в том числе 1404 моряка-десантника. Из-за боевых потерь многие роты, отряды и команды, отведенные в тыл, были расформированы. В одном только 5-м Восточно-Сибирском стрелковом полку из 23 офицеров выбыли в ходе отражения штурма 14, из 26 зауряд-прапорщиков - 17, из 1805 нижних чинов - 1251 человек. То есть численность полка стала меньше одного стрелкового батальона.
С горы Высокой японцы незамедлительно начали корректировку огня осадных батарей по кораблям русской эскадры в порт-артурской гавани. Первым погиб эскадренный броненосец "Полтава" - в ее левый борт попал 11-дюймовый снаряд, который разорвался в погребе, где хранились снаряды для 47-миллиметровых пушек. Взрывом были пробиты дно корабля и переборки погреба. Начался пожар, от которого загорелся другой погреб с 12-дюймовыми снарядами. Новый сильный взрыв разрушил водонепроницаемые переборки, и броненосец медленно опустился на дно гавани почти до самой верхней палубы.
Корректировщики на горе Высокой хорошо знали свое дело. Восемь снарядов попало в эскадренный броненосец "Ретвизан", но он остался на плаву. На следующий день японцы выпустили более 500 11-дюймовых снарядов и потопили броненосцы "Ретвизан" и "Пересвет". Затем их участь разделили эскадренный броненосец "Победа" (он получил 23 попадания японских снарядов), крейсера "Паллада" и "Баян". Был сильно поврежден военный транспорт "Амур".
К концу дня 25 ноября из всей броненосной порт-артурской эскадры неповрежденным и непотопленным остался только эскадренный броненосец "Севастополь". Вместе с ним в строю оставались канонерская лодка "Отважный", семь миноносцев и военный пароход "Силач". В ночь на 26 ноября "Севастополь", по инициативе его командира капитана 1-го ранга Н.О. Эссена, вышел из гавани на внутренний рейд и на рассвете бросил якорь в бухте Белый Волк, где уже стояла канонерская лодка "Отважный".
На следующий день японская осадная артиллерия, в пасмурную погоду, выпустила по месту стоянки "Севастополя" во внутренней гавани около 300 крупнокалиберных снарядов. Обстрел Восточного бассейна гавани прекратился только в полдень, когда видимость заметно улучшилась. Командующий Соединенным флотом вице-адмирал Хейхатиро Того, узнав о выходе русского эскадренного броненосца из гавани, приказал атаковать его и уничтожить.
Атаки японского флота на броненосец "Севастополь", стоявший в бухте Белый Волк, продолжались в течение шести ночей подряд. В них участвовали большие силы: 10 отрядов эскадренных миноносцев (всего 30 кораблей), 2 минных заградителя и 3 минных катера под общим командованием капитана 1-го ранга Имаи. Настойчивые попытки потопить "Севастополь" дорого обошлись нападавшим - два японских миноносца оказались потопленными, а еще три и два минных катера получили большие повреждения и надолго вышли из строя. Заградительный огонь орудий броненосца оказался губительным для вражеских миноносцев в ходе их ночных торпедных атак.
Торпедные атаки прекратились только 2 декабря: вице-адмирал Хейхатиро Того решил, что русский броненосец получил такие серьезные поврежения (в него попали две торпеды и было затоплено несколько отсеков), что он должен обязательно погибнуть. В ходе минных атак на "Севастополь" японцы выпустили в общей сложности 180 торпед. Однако броненосный корабль с сильной артиллерией остался на плаву и до последнего дня обороны Порт-Артура поддерживал его защитников огнем своих орудий. Перед сдачей Порт-Артура "Севастополь" был отведен из бухты на глубокое место и затоплен своей командой.
В те дни, когда отряды японских эскадренных миноносцев безуспешно пытались торпедировать и пустить на морское дно броненосец "Севастополь", императорский Соединенный флот понес еще одну большую потерю. Несший блокадную службу отряд крейсеров в составе "Акаси" и "Такасаго" оказался на краю выставленного русскими минного заграждения, и оба коробля подорвались. Крейсер "Такасаго" пошел на дно, при этом погибло около 300 человек его команды.