В новых условиях иноземного господства кроме особенности накопления негативных эмоций, о которой писал Наливкин, приходилось учитывать антироссийскую пропаганду, ее постоянно вели среди мусульманского населения исламские священнослужители. Эти обстоятельства стали причиной (не единственной), по которой кочевое и оседлое население Средней Азии было освобождено от обязанности нести воинскую повинность. К.П. фон Кауфман считал недопустимым легкомыслием обучать туземцев европейской манере ведения боя, а также владению современной военной техникой. Серьезным предупреждением в этом отношении было восстание индийских сипаев в 1856–1857 гг.
В первые два десятилетия российского присутствия в Туркестане численность войск империи не превышала 30 тысяч солдат и офицеров, в то же время мусульманское мужское население края насчитывало не менее 1150 тысяч человек. Поэтому было очень рискованно отбирать из этого числа даже небольшую часть мужчин для несения воинской службы – в случае массовых беспорядков они могли стать организаторами, способными цементировать стихийные толпы.
Успокаивающими факторами были превалирующая пассивность населения, его разобщенность, многоэтнический состав и, как результат, неспособность согласовывать свои действия. Для обитателей тех краев к тому же был характерен так называемый местный патриотизм, не выходящий порой за пределы родного кишлака.
Самым потенциально взрывоопасным районом считалась густонаселенная Ферганская долина, где приверженность исламским догмам ее обитателей была наиболее выраженной. Здесь, как, пожалуй, нигде в других частях Туркестана, были сильны позиции и влияние суфийских (дервишских) орденов, настроенных резко против русских. Именно в этом центральном пространстве края время от времени почти с первых лет российского присутствия вспыхивали мелкие бунты, инспирированные дервишами. Все эти выступления имели целью освобождение Ферганы из-под власти неверных. Самым крупным был мятеж, поднятый в 1885 г. бывшим чиновником Кокандского ханства Дервиш-ханом. Беспорядки охватили несколько уездов, в том числе Андижанский. Карательная команда очень быстро подавила мятеж. Это выступление не вызвало особого беспокойства ни у властей Туркестана, ни в Петербурге.
Проходили годы, и обстановка в Туркестане менялась. После четырнадцати лет управления краем, вместивших военные походы, глубокие реформы и важные экономические начинания, сошел со сцены «полуцарь», имевший большую власть, Константин Петрович фон Кауфман. В начале 1881 г. его сразил тяжелейший инсульт, и более года вплоть до своей кончины 3 мая 1882 г. он лежал парализованный в своем дворце. Его преемники на посту генерал-губернатора не могли по масштабу личности равняться с ним, да и многих прерогатив должности их лишил Императорский указ. Кауфман был не только завоевателем, но и первоустроителем края, отчего пользовался особым авторитетом как в Петербурге, так и в Туркестане, более того – он управлял среднеазиатскими народами намного дольше тех, кто приходил ему на смену: иные начальники края исполняли должность всего лишь год. Никого из генерал-губернаторов послекауфманской поры не называли «полуцарем», да и возможностей приобрести славу фон Кауфмана у них уже не было – им оставалось продолжать его дело.
Постепенно у аборигенов прошел страх перед чужеземцами с их пушками и скорострельными винтовками. Неверные не рубили головы, не резали людям горло, как баранам, не занимались членовредительством, не сажали на кол, не громили мечети, не мешали муэдзинам кричать с минаретов, не трогали жен и дочерей правоверных, не мешали торговать, то есть практически не вмешивались в устоявшиеся веками обряды и обычаи. Гяуры были как бы сами по себе, а правоверные тоже сами, и это не прибавляло уважения к завоевателям. Страх прошел, а склонность к бунту сохранилась.
Пожалуй, только в 1892 г., спустя более четверти века после начала интенсивного силового проникновения России в Среднюю Азию, русская администрация столкнулась с серьезным возмущением местного населения, причем в Ташкенте – столице генерал-губернаторства.