27 февраля С.О. Макаров вывел флот в море для эволюции и осмотра ближайших островов. Всего за время его командования главные силы флота выходили из Порт-Артура шесть раз, при этом выход осуществлялся в одну полную воду, что до войны считалось невозможным. Походы сопровождались маневрированием: флот осваивал «Инструкцию для похода и боя», которая явилась своеобразным прообразом Боевого устава, дополнив тактическими рекомендациями «Морской устав» издания 1899 г. В походе 13 марта к островам Мяо-Тао крейсер «Новик» под командованием Н.О. Эссена и эскадренные миноносцы уничтожили японский пароход «Ханиен-Мару» и взяли в плен его экипаж. Не всё происходило гладко: тогда же, 13 марта «Пересвет» столкнулся с «Севастополем» и нанёс последнему повреждение кормы и винта. Но интенсивная подготовка флота, активность и энергия командующего внушали уверенность в успехе. В начале марта лейтенант броненосца «Севастополь» В.Н. Черкасов записал в дневнике: «Адмирал Макаров усиленно проявляет свою деятельность и готовит эскадру к бою. Его приказы прекрасны и хорошо написаны. Они вполне соответствуют данному положению. Если все командиры проникнутся его идеями и точно и толково будут выполнять намеченный им план, то, мне кажется, что с наличным числом кораблей мы свободно побьём не только японский, но и соединённый англо-японский флот, если только англичане вздумают сюда впутаться». 10
Вторая бомбардировка японским флотом Порт-Артура, предпринятая утром 9 марта, была сорвана не только ответным — «перекидным» огнём «Ретвизана» и «Победы», но и неожиданным для противника выходом российского Тихоокеанского флота в море. К 10 час. 30 мин. во главе с С.О. Макаровым (флаг на «Аскольде») на внешнем рейде оказались 7 броненосцев и крейсеров. Вице-адмирал X. Того с присоединением прервавших бомбардировку броненосцев «Ясима» и «Фудзи» (снаряд «Ретвизана» упал в 4 м от его носа) имел 18 кораблей. Однако японский главнокомандующий не решился атаковать русский флот, маневрировавший под прикрытием береговых батарей, и отступил.
Неудача бомбардировки ускорила подготовку второй закупорочной операции японцев, проведенной в ночь на 14 марта. К этому времени японский флот перенёс всю маневренную базу в устье реки Пеньянг и к островам Джеймс Холл, которые находились в 180–195 милях от Порт-Артура. Смелая ночная атака четырёх пароходов-заградителей под командованием капитана 2-го ранга Т. Хиросе натолкнулась на организованную оборону. Пароходы были своевременно обнаружены с береговых постов и дежурной канонерской лодки «Бобр», на которой находился сам С.О. Макаров. Под ураганным огнем с берега и канонерской лодки эскадренный миноносец «Сильный» лейтенанта Е.И. Криницкого подорвал миной головной японский пароход, сбив его с курса. Третий в строю брандер был подорван «Решительным». В возникшем замешательстве пароходы не смогли затопиться на фарватере и выбросились на берег. Выбросился на берег и «Сильный», повреждённый в бою с японскими миноносцами «Аотака» и «Цубаме». На «Сильном» погибли 7 человек во главе с инженером-механиком В.В. Зверевым, но и японцы понесли тяжёлые потери, погиб и командир экспедиции Т. Хиросе, ставший японским национальным героем. Русские офицеры не уступали ему в доблести: лейтенанты М.А. Кедров, Н.Н. Азарьев и мичман Г.С. Пилсудский, вызвавшись добровольцами, разоружили на брандерах «адские машины» (подрывные устройства) и потушили пожары, освещавшие противнику вход в гавань.
Закупорка провалилась, и в этом вице-адмирал Того имел возможность убедиться, появившись с Соединённым флотом у Порт-Артура утром 14 марта. Флот Тихого океана быстро вышел в море во главе с С.О. Макаровым на «Петропавловске». Несмотря на благоприятное соотношение сил, X. Того упорно не желал рисковать генеральным сражением. Он в очередной раз отступил, сознавая, что бомбардировки и закупорочные операции не смогли парализовать активность российского флота. Однако С.О. Макаров из-за неблагоприятного соотношения сил был вынужден к шаблонному маневрированию у Порт-Артура — по «восьмёрке» под прикрытием береговых батарей. Вынужденный и замеченный японцами шаблон подсказал X. Того и его штабу возможность эффективного применения минного оружия. Постановка мин была поручена командиру отряда заграждения Соединённого флота капитану 2-го ранга К. Ода. В его распоряжении находились вспомогательный заградитель «Кориу-Мару» и 12 истребителей и миноносцев. Прикрытие операции возлагалось на 4 истребителя 2 отряда капитана 2-го ранга И. Исида, благоприятные условия для её проведения (облачность, туман) сложились в ночь на 31 марта 1904 г. Утром этого дня X. Того готовился привести к Порт-Артуру главные силы Соединённого флота, пополненного только что вступившими в строй броненосными крейсерами «Ниссин» и «Касуга».