В своем приказе генерал-майор Г.А. Вержбицкий писал:
26 августа 1918 г. дивизия Вержбицкого переименовывалась в 1-ю Сибирскую стрелковую. Осенью 1918 г. генерал-майор Г.А. Вержбицкий, командуя Западно-Сибирским отрядом, выбил большевиков из бассейна река Тавды и городов Алапаевска, Нижнего Тагила и Верхотурья, а также очистил от красных Горнозаводской район. Генерал-майор Г.А. Вержбицкий совместно с командиром 1-го Средне-Сибирского армейского корпуса генерал-майором А.Н. Пепеляевым участвовал в успешном взятии города Перми 24 декабря (ст. ст.) 1918 г.
С 1 января 1919 г. Г.А. Вержбицкий был назначен командующим 3-м Степным армейским корпусом Сибирской армии. В состав корпуса входили 4-я Сибирская стрелковая дивизия полковника И.С. Смолина и 7-я Сибирская стрелковая дивизия полковника Черкасова. С 22 января по 2 марта 1919 г. Г.А. Вержбицкий участвовал в Кунгурской операции, в ходе которой он разгромил 23-тысячную группировку противника, захватил ряд укрепленных позиций красных с городом Оса. В плену оказались 3500 красных, также досталось множество трофеев, среди них 9 орудий. В феврале 1919 г. за боевые отличия по овладению Уральским хребтом Григорий Афанасьевич был произведен в генерал-лейтенанты. В весеннем наступлении Русской армии адмирала А.В. Колчака корпус Г.А. Вержбицкого 7 апреля 1919 г. овладел Боткинским заводом, а 13 апреля был взят Ижевск{517}
. 9 апреля 1919 г. союзным французским командованием генерал-лейтенант Григорий Афанасьевич был награжден французским Военным крестом (Croix de Guerre) с пальмовой ветвью.С 20 апреля 1919 г. генерал Вержбицкий стал членом думы георгиевских кавалеров Западной армии. С июня 1919 г. Г.А. Вержбицкий — командующий Южной группой войск Сибирской армии. 4 июля 1919 г. генерал-лейтенант Г.А. Вержбицкий за Кунгурскую операцию был награжден орденом Св. Георгия III степени. После многочисленных поражений Русской армии адмирала А.В. Колчака был оставлен Урал. С 20 июля 1919 г. группа войск генерал-лейтенанта Г.А. Вержбицкого стала именоваться Южной группой войск 2-й армии. В это время в нее входили 4-я и 18-я Сибирские стрелковые дивизии и Штурмовая бригада 3-го Степного корпуса. В Великом Сибирском ледяном походе (ноябрь 1919 г. — март 1920 г.) в конце 1919 г. генерал-лейтенант Г.А. Вержбицкий был назначен начальником колонны на правах командующего армией, в составе Южной и Тобольской групп.
23 января 1920 г. на совещании старших начальников в Нижнеудинскс главнокомандующий фронтом генерал-лейтенант В.О. Каппель поручил командование 2-й армией генерал-лейтенанту Г.А. Вержбицкому, для которого Ледяной поход закончился но прибытии в Читу 11 марта 1920 г. Стоит также упомянуть о том, что с 22 февраля по 22 августа 1920 г. Григорий Афанасьевич был еще и командующим Сибирской группой войск в Забайкалье. В Чите из-за сократившейся численности 2-я армия была сведена во 2-й отдельный стрелковый корпус Дальневосточной армии{518}
. В апреле 1920 г. Григорий Афанасьевич был награжден орденом «За Великий сибирский поход» I степени.С 30 марта по 4 июля 1920 г. генерал-лейтенант Г.А. Вержбицкий вел борьбу с красными в Нерчинско-Сретенском районе. 22 августа 1920 г. Г.А. Вержбицкий был назначен временным командующим Дальневосточной армией. 22 октября 1920 г. из Читы с армией отступил в Маньчжурию. В Маньчжурии, несмотря на давление китайских властей, сохранял воинскую структуру армии. В начале 1921 г. но договору с представителями Приморского областного управления воинские части разместились в Гродекове, Никольскс-Уссурийском, Раздольном и Владивостоке. В январе 1921 г. во Владивостоке состоялись выборы в Учредительное собрание Дальневосточной республики. Среди избранных депутатов был и Г.А. Вержбицкий. 26 мая 1921 г. во Владивостоке произошел государственный переворот, в ходе которого к власти пришло несоциалистическое Временное Приамурское правительство С.Н. Меркулова.