В декабре 1987 года, когда все более-менее утряслось, Егор возвращается в Омск и через месяц приступает к записи альбома «Все идет по плану». Кузя Уо к этому времени уже вернулся из доблестных красноармейский рядов, но никак не мог прийти в себя. Так что «Все идет по плану», «Так закалялась сталь» и «Боевой стимул» Летов записывал фактически один, хотя Кузя Уо и Манагер оказывали посильную помощь. Тогда же записываются проекты Димы Кузьмина «Черного Лукича» — «Эрекция лейтенанта Киреева», «Кучи в ночи» и «Кончились патроны» (состав: Черный Лукич, Егор Летов, Кузя Уо).
С весны 1988 года у ГО начинается активная концертно-гастрольная жизнь. В апреле «Гражданская Оборона» (состав: Егор Летов — барабаны, вокал. Дмитрий Селиванов — гитара. Джон Дабл — бас. Манагер — вокал) выступила на втором Новосибирском рок-фестивале, в июне — на Тюменском фестивале альтернативной и леворадикальной музыки (состав: Егор Летов — бас-гитара, вокал, Манагер — вокал; Игорь «Джеф» Жевтун (Инструкция По Выживанию) — гитара: Аркаша Климкин (экс-«Ассоциация Пых») — барабаны), а в сентябре — на Вильнюсском панк-фестивале (состав: Летов — бас, вокал; Джеф — гитара; Климкин — барабаны). На этом фестивале ГО была единственной русскоязычной группой.
В октябре группа (состав: Летов — вокал, Джеф — гитара, Игорь Староватов (экс-«Ассоциация Пых») — бас, Климкин — барабаны) собирается в Новосибирске с целью сыграть несколько концертов и записать студийный альбом. Был дан концерт в общежитии № 5 Академгородка, но альбом записать не удалось. А в конце января ГО (состав: Летов, Джеф, Климкин) и Янка отправляются в Питер, где в это время французскими журналистами снимается фильм о рок-жизни в Советском Союзе. Их питерский концерт входит в этот фильм. По рекомендации Сергея Фирсова «Гражданская Оборона» вступает в Ленинградский рок-клуб. В феврале ГО и Янка выступают в Москве и на харьковском рок-фестивале. В марте Джеф объявляет о своем уходе из группы и в апреле в Симферополе играет прощальный концерт.
Между концертами в ГрОб-студии, которая компактно расположилась на омской квартире Егора Летова, записываются многочисленные альбомы проекта Летова, Кузи Уо и Манагера «Коммунизм».
В июне на новосибирском концерте, посвященном памяти Дмитрия Селиванова, на сцене появляется Кузя Уо с бас-гитарой в руках, который до этого в концертной деятельности ГО участия не принимал. В составе Летов — Кузя Уо — Климкин группа выступает на 7 фестивале ленинградского рок-клуба. В июле на киевском концерте вновь появляется Джеф.
Затем ГО возвращается в Ленинград в надежде записать очередной студийный альбом. Поиски подходящей студии не увенчались успехом и тогда всё необходимое для записи (в том числе и репетиционную точку) бескорыстно предоставила группа «Аукцыон». Результатом явилась записанная в живую концертная программа (альбом «Песни радости и счастья») и другие песни, позднее вошедшие в различные сборники.
ГО отбывает в Омск для записи альбомов «Здорово и вечно», «Армагеддон попс», «Война», «Русское поле экспериментов», а также нескольких сборников, каковые и увидел свет в октябре 1989 года. После короткого отдыха группа отправляется (в конце октября же) в Москву на очередной концерт, а в начале ноября уже в Ленинграде записывает песню «Новая правда» на передвижной студии «Next Stop Rock'n'Roll», впоследствии вышедшей на кассете в Дании. Затем по просьбе русской диаспоры г. Таллина играют там концерт. В декабре ГО выступает в Барнауле, а в феврале 1990 года в ДК МЭИ в Москве. В апреле проходят концерты в Киеве.
В начале 1990 года с разрешения Романа Не-умоева ГО записывает альбом «Инструкция по Выживанию», который полностью состоит из песен «Инструкции».
13 апреля 1990 года «Гражданская Оборона» объявляет о своем самороспуске и дает последний концерт в Таллине. Летову необходимо либо выскочить из этого потока, либо невиданным усилием воли обратить его течение в другую сторону, ибо в восприятии творчества группы началась самая настоящая инерция, имеющая к тому же коммерческий характер. Летом в Омске записывается альбом «Прыг-Скок или детские песенки» (в записи принимают участие: Егор Летов, Игорь Жевтун, Кузя Уо и Юлька Шерстобитова). Это первый альбом группы, вышедший сначала на виниле, а затем на компакт-диске. Следом на виниле выходят два сборника: «Попс» и «Все идет по плану».
После записи «Прыг-Скока» начались метафизические поиски, которые продолжались до 1992 года. Летов лег на дно. Перестал давать интервью и на все предложения со стороны организаторов концертов отвечал решительным отказом. «Я разрабатывал те принципы, которые были заложены в песне „Прыг-скок“ и доводил их до полного логического завершения. Таким завершением явился альбом „Сто лет одиночества“. Эти поиски были связаны с ЛСД, с медитацией, с дыханием и со всевозможной трансцендентной работой. Окончание этого периода совпало со штурмом „Белого дома“. Тогда мне окончательно стало ясно, что нужно опять возвращаться в жизнь, в реальность».