Тем временем еще в начале марта морской министр запросил у регента разрешение на выход вспомогательных крейсеров на международные морские пути. На обсуждение данного предложения был приглашен министр иностранных дел, который со скрипом согласился на операцию при условии что операция будет проводится в прилегающих к Японии водах и не более 1-2 месяцев, ибо возможны дипломатические осложнения в свете предстоящего выхода 2 ТОЭ. На всех вспомогательных крейсерах были почищены котлы и перебраны механизмы, крейсера были частично перевооружены и по окончании подготовки утром 14 апреля вышли в море и направились в Николаевск-на-Амуре, куда прибыли спустя трое суток. Дождавшись улучшения погоды маленькая эскадра вновь вышла в море. Выйдя из Татарского пролива крейсера повернули на восток, кроме “Лены” которая направилась на северо-восток. Остальные крейсера проскочили через Кунаширский пролив в океан где их пути и судьбы окончательно разделились.
Крейсер “Лена” спустя пару суток с момента выхода в море встретил, досмотрел и затем потопил артиллерией шхуны “Койо Мару” и “Хокузей Мару”, занимавшиеся морским промыслом. 25 апреля в районе острова Уруп были потоплены японские зверобойные шхуны “Явата Мару N 3” и “Явата Мару N 1”. 30 апреля в районе острова Симушир были обнаружены и потоплены зверобойные шхуны “Яйя Мару” и “Сенрио Мару”. 3 мая в районе острова Матуа крейсер потопил промысловые шхуны “Тайо-мару N2”, “Санкио-мару” после чего повернул обратно в Николаевск. На обратном пути встретился только небольшой пароход п/х “Саво-мару” (250 тонн в/и) который тоже был пущен ко дну. 11 мая крейсер вернулся в Николаевск-на Амуре. Тем временем кого-то в штабе Манчжурской армии осенила гениальная идея о необходимости проверить, что проиходит в Петропавловске-на-Камчатке, уже более года отрезанном от России и отвезти туда небольшой гарнизон. Руководствуясь полученными инструкциями, на борт крейсера “Лена” была принята сводная пехотная рота и 2 батареи: тяжелая полевая из 4-х 6” 120 пудовых 6” орудий и полевая батарея из 8 87 мм легких орудий с расчетами.Закончив погрузку угля и запасов, а также приняв груз, крейсер вечером 16 мая вышел в море.
Спустя пять дней 21 мая крейсер отдал якорь на рейде Петропавловска-Камчатского, на берег были перевезены солдаты и орудия, притом 6” орудия были установлены на месте старой батареи Максутова. Командир крейсера капитан 2 ранга Берлинский принял решение осмотреть остров Шумшу, так как там по информации дружинников была устроена база, откуда и устраивались набеги на русский берег. Сутки спустя крейсер вышел в море и днем следующего дня подойдя к японскому поселку на Шумшу, открыл по нему артиллерийский огонь, выпустив сотню снарядов разным калибров. Высаженный десант сжег поселок и стоявшие у берега шхуны. В плен взято 44 японца. После разгрома, когда на берегу еще догорали строения, крейсер поднял якорь и ушел во Владивосток, куда прибыл 5 июня.