Сметанова полностью признала свою вину, заключила досудебное соглашение со следствием и «выразила готовность продолжать сотрудничество со следствием в раскрытии и расследовании преступлений, а также в изобличении участников противоправных действий».
Дело быстро набирало обороты. 22 ноября 2012 года в ходе расследования дела «Оборонсервиса» проведены 18 обысков в коттеджах бывших высших чиновников Минобороны. Обыск проведен и в коттедже Сердюкова, находящемся на территории санатория-профилактория «Подмосковье» на Учинском водохранилище.
28 ноября 2012 года Следственный комитет России сообщил, что ущерб от хищений в «Оборонсервисе» составляет уже 6,7 млрд. руб. В ходе следствия у подозреваемых изъяты деньги и ценности на сумму более 1 млрд. руб.
30 ноября 2012 года на встрече с думскими фракциями президент России В. Путин заявил, что расследование громких коррупционных дел вокруг Минобороны не является кампанией, и будут созданы все условия для объективного расследования.
20 декабря 2012 года В. Путин на пресс-конференции заявил, что при наличии оснований Сердюков будет привлечен к уголовной ответственности, и его будут судить, невзирая на прошлые заслуги и регалии. Однако… никаких обвинений ему не было предъявлено ни в декабре, ни позже. Дело затягивалось. Экс-министру даже не посмели надеть браслет на ногу, как Васильевой. А Бастрыкин еще и пошутил по этому поводу: «Ну, куда он убежит?».
А казалось бы, уже пора брать «Маршала Табуреткина». В декабре 2012 года бывший глава юридической службы ООО «МИРА» Дмитрий Митяев, уже находившийся в СИЗО, рассказал следствию, что Сердюков лично выпускал директивы и давал указания членам совета директоров «Оборонсервиса», в который входили сам министр обороны и его подчиненная Евгения Васильева, как голосовать по вопросу продажи того или иного военного имущества. Ценные показания дала также Екатерина Сметанова, которая подбирала покупателей для реализуемого по заниженным ценам имущества Минобороны РФ. По данным «Известий», Сердюков лично утверждал план реформирования холдинга «Оборонсервис». Этот документ устанавливал сроки ликвидации и приватизации предприятий ведомства с нарушениями закона.
28 декабря 2012 года Сердюков явился на допрос в Следственный комитет РФ и отказался давать показания по делу о хищениях в «Оборонсервисе», сославшись на отсутствие заболевшего адвоката. Допрос перенесен на 11 января 2013 года.
11 января 2013 года Сердюков в сопровождении адвоката Генриха Падвы явился на допрос в СК РФ, где письменно представил свою версию продажи имущества Минобороны, но от дачи устных показаний отказался.
12 января 2013 года стало известно, что в процессе доследственной проверки оперативники установили, что Минобороны РФ при Сердюкове активно способствовало развитию бизнеса зятя министра Валерия Пузикова — мужа сестры Галины. В ходе проверки установлена прямая заинтересованность Сердюкова в финансировании строительства дороги к базе отдыха «Житное» в дельте Волги, принадлежащей его зятю, за счет бюджетных средств. Сердюков проводил в «Житном» все лето, занимался рыбалкой и принимал высокопоставленных гостей, включая Путина и Медведева. В конце января 2013 года Главное военное следственное управление (ГВСУ) возбудило уголовное дело по статье «злоупотребление должностными полномочиями» при строительстве автодороги к даче зятя Сердюкова.
19 февраля 2013 года, будучи вызванным на допрос вместе с Е. Васильевой, Сердюков вновь отказался давать показания в СК РФ и помогать следствию в расследовании преступлений в Минобороны.
6 марта, Васильева побывала на очередном допросе в Следственном комитете. Как и во время предыдущих визитов к следователю, она отказалась отвечать на вопросы, сославшись на статью 51 Конституции РФ. Эта норма закона позволяет подозреваемым и обвиняемым не свидетельствовать против себя и своих близких.
Точно в такую же непризнанку играл и Сердюков. Но как только следствие получило самые подробные показания на Сердюкова в связи с «Житным», он сам прибежал в Следственный комитет и заявил, что этот «домик рыбака» он строил якобы в связи со «служебной необходимостью». Одно дело, как выяснялось, вытекало из другого и в другое переходило. Сердюкову предстояло объяснить, почему вместо того, чтобы построить РЛС под Анапой на участке, выделенном Минобороны для этой цели, он принялся там строить свою виллу. А затем и по эпизодам изыскивать «служебную необходимость».