Как только до Петра дошла весть об открытии зимней кампании шведами, он спешно выехал к армии. На пути у Дубровно он встретился с Меншиковым, от которого узнал подробности создавшегося положения. С этого времени Петр I берет управление армией в свои руки и дает ряд распоряжений: обеспечить осажденных в Гродно продовольствием, не допускать связи Карла с Левенгауптом.
Особенное внимание обращается на укрепление старой русской государственной границы. Вдоль западной границы от Пскова через Брянск и до южных степей были устроены засеки. В наиболее важных пунктах на больших дорогах, пересекающих границу, силами местных жителей возводились укрепления. Прикрывать границу Русского государства было приказано корпусу Меншикова.
Между тем положение осажденной русской армии в Гродно, ожидавшей скорого возвращения Августа с подкреплениями, становилось все более и более тяжелым. Быстро таяли запасы. План Августа, рассчитанный на разгром Реншельда с последующим затем движением в Гродно для выручки русской армии, был разрушен: 4 февраля у Фрауштадта саксонская армия потерпела полное поражение от шведов. Август вынужден был с остатками разбитой армии отойти к Кракову. Положение русской армии становилось критическим. Оставался единственный выход — отвести армию из Гродно на Брест и дальше к Киеву. Переход русской армии был гениально осуществлен по оперативному плану, разработанному Петром I и его сподвижниками. Это было сделано вопреки мнению фельдмаршала Огильви, который хотел вести русские войска к Варшаве.
27 февраля Петр I отдал Огильви категорическое приказание отступить от Гродно.
Огильви, будучи противником оперативного плана Петра I, не хотел выводить армию из окружения от Гродно к русским границам. Он ведет переписку с Августом по поводу отвода русской армии к Варшаве.
Переписку с Августом Огильви держал в строжайшей тайне. О ней знали только немногие генералы из иностранцев. Но сведения о переписке дошли до Репнина, который сообщил о ней Петру. После этого Петр I со всех директив, посылаемых Огильви, приказал снимать копии и посылать их Репнину, который по существу возглавлял русскую армию. После этого Огильви вынужден был выполнять приказы Петра I.
22 марта на Немане тронулся лед. На другой день Огильви переправил русскую армию на левый берег Немана и выступил к Бресту, куда она и прибыла 4 апреля. Между тем построенный Карлом XII выше Гродно мост был разрушен ледоходом, и шведская армия смогла перейти Неман только 3 апреля. Карл XII, предугадывая путь отступления русской армии, решил двинуть свои войска для преследования наперерез к Пинску. Но, несмотря на форсированный марш, он не мог догнать русской армии, так как она уже успела пройти Ковель, в то время как Карл XII подходил к Пинску. У Пинска шведская армия простояла целый месяц, а затем перешла в Луцк и Дубно, на Волыни.
Карл XII, убедившись в том, что русская армия удачно выскользнула из-под его ударов, решил вновь все свои силы бросить против Августа II и нанести ему окончательный удар в его владениях. В сентябре 1706 г. шведская армия была уже под Лейпцигом.
Август II, боясь потерять не только польскую корону, но и свой наследственные владения, капитулировал перед Карлом и 24 сентября 1706 г. заключил унизительный мирный договор в Альтрандштадте. Он отрекся от польской короны, признав Станислава Лещинского королем Польши и Литвы. Кроме того, он согласился выдать всех пленных и уплатить большую контрибуцию и отказался от союза с Петром I.
Теперь Петр I остался без союзников. Всю тяжесть войны со шведами Русскому государству предстояло взять на себя.
Несмотря на успех русской армии в Прибалтике, внешнеполитическое положение Русского государства продолжало оставаться тяжелым. В особенности осложнилось положение в связи с выходом из союза Августа II. Международная обстановка требовала исключительного напряжения от русских дипломатов, поставив перед ними очень сложную задачу: во что бы то ни стало изолировать Швецию, не дав ей возможности использовать в борьбе с Россией Польшу и Турцию. Надо было парализовать происки шведского короля, который добивался от западноевропейских государств, в особенности от Англии и Голландии, материальной помощи для войны против России.
В центре внимания русской дипломатии стоял вопрос о союзниках. Надо было всеми мерами удержать в союзе Августа и его сторонников в Польше.
Петр I принимает все усилия к тому, чтобы поддержать Сандомирскую конфедерацию, во главе которой стоял сторонник Петра I коронный гетман Адам Синявский.
7 февраля 1707 г. в городе Львове Сандомирская конфедерация на своем совете, подтвердила отрицательное отношение к Станиславу Лещинскому и возобновила военный договор с Россией. Это была крупная дипломатическая победа России. Шведский король вынужден был держать в Польше усиленный корпус Крассау для того, чтобы поддерживать своего ставленника Станислава Лещинского. Хотя Карл XII и рассчитывал на Польшу, но он не мог использовать войска Лещинского, ибо тот мог держаться у власти только при помощи штыков.