Обвинив его в руководстве революционным движением и в контактах с англичанами, Файеза арестовали, посадили в тюрьму и подвергли, вместе с двумя предполагаемыми соратниками, военно-полевому суду Алей в Бейруте. Его судили вместе с товарищами Абдулом Беком эль-Вуахаб по прозвищу эль-Инглизи («Англичанин») и Шукри Беком эль-Ассали, которые были и адвокатами, и судьями в Османской империи. Этих двоих людей приговорили к смерти и казнили.
Файеза эль-Гусейна тоже приговорили к смерти, но определили ему казнь в другом городе, который в тот момент находился под контролем немецкой армии. Он продолжал отбывать тюремное заключение, а затем, без видимой причины, казнь заменили ссылкой в Эрзерум. Джемаль-паша поручил надзор за его перемещением отряду из пяти солдат под командованием офицера.
Путь, который они проделали частично пешком и частично в повозке, был долгим: Дамаск, Хама, Алеппо, Сер-Араб-Пунари, Серуж, Урфа, Кара-Джурн, Северек, Диарбекир. Он рассказывал об ужасах, увиденных им на каждом этапе пути, о встречах с убийцами и с высокопоставленными чиновниками.
В Диарбекире выяснилось, что поездка не может продолжаться, поскольку русские заняли территории, прилегающие к Эрзеруму. Файеза заточили в тюрьму, но он пробыл там всего 23 дня: за него вступились друзья, с которыми он был знаком, когда еще был каймакамом.
Приговор был заменен ссылкой на поселение. Он прожил в том районе шесть месяцев и все это время собирал сведения у турецких офицеров, чиновников, именитых граждан, влиятельных лиц, которые рассказывали ему о том, что происходит с армянами. Он видел колонны депортированных, был свидетелем невообразимых сцен, когда грабили, пытали, насиловали, проливая кровь невинных женщин, стариков и детей.
Файез начал думать о побеге. За ним по-прежнему следили. Но однажды ему удалось это осуществить. Находясь на улице под конвоем солдат, он нагнулся, набрал горсть песка, бросил его в лицо своим надзирателям и, воспользовавшись минутным замешательством ослепленных солдат, смог убежать и спрятаться.
Велика была опасность оказаться снова схваченным. С большими предосторожностями, прячась днем и передвигаясь ночью в течение 70 суток, он сумел добраться до Басры, где вступил в контакт с английскими властями и встретился с одной дамой, по имени мисс Белл, ответственной за английскую администрацию в Басре. Он рассказал ей свою историю и объяснил причину, из-за которой он ведет борьбу: «Османы хотят, чтобы арабы отуречились, это так называемая политика
Семья несколько лет ничего о нем не знала. Англичане отправили его в Индию — сперва в Бомбей, затем в Дели. Через несколько лет на военном корабле его переправили в Джеддах, в эль-Джазиру эль-Арабие (нынешняя Саудовская Аравия), где он встретился с Шарифом эль-Хусейном (сын которого Шариф эль-Фейсал — впоследствии король страны Билад-эль-Шама) и стал его советником. Шариф эль-Хусейн объявил «великую арабскую революцию» против Османской империи.
В это время Файез эль-Гусейн познакомился с Лоуренсом Аравийским, который позднее вспоминал о нем в своей знаменитой книге «Семь столпов мудрости». Вместе с Шарифом эль-Фейсалом и Лоуренсом Файез трудился во имя независимости арабов.
По окончании войны, в которой победили страны Антанты, Файез вернулся в Дераа и затем в Дамаск, где стал секретарем Шарифа эль-Фейсала, первого и единственного короля новообразованного государства «Билад эль-Шам», состоявшего из нынешних Сирии, Ливана, Иордании и Палестины. Его царствование продолжалось всего два года; после закрепления французов в Сирии Шариф эль-Фейсал бежал в Ирак, в то время занятый англичанами.
Когда закончилась война, Файез эль-Гусейн обосновался в Дамаске и был назначен судьей в уголовном суде. Затем его направили на ту же должность в Алеппо, и там в 1931 году родился я, сын его второй жены. Потом Файез снова вернулся в Дамаск, оставил должность судьи и стал работать адвокатом, потому что, будучи человеком праведным, он не хотел судить своих соотечественников от имени французов.
От первой жены, принадлежавшей к семье эль-Угейл, на которой он женился до ссылки в Диарбекир, у него было четверо детей: двое сыновей, ныне усопших, и две дочери, которые и сейчас живы. Его вторая жена Ифакат, моя мать, была девушкой из Сейраванов — турецкой семьи, жившей в Сирии. Ифакат родила ему пятерых детей: нижеподписавшегося (Кусая) и четырех дочерей. Файез эль-Гусейн написал четыре книги. Кроме книги об избиении армян, он опубликовал свои мемуары, которые в настоящее время находятся в Государственной библиотеке в Аммане, в Иордании.
5. Генеалогическое древо Файеза эль-Гусейна, составленное его племянником Ахметом