Компоновка второго отсека длиною 0,75 и осталась без изменений. В центральном посту длиною 4,8 и были установлены приборы управления подводной лодкой, средства навигации, цистерна главного балласта N 3, цистерна быстрого погружения. По боевой тревоге экипаж, увеличенный до четырех человек за счет введения штатного водолаза-рулевого, располагался в этом отсеке.
Боевая рубка имела длину 1,2 м и высоту 0,6 м, за ней был установлен входной люк. Управлялась подводная лодка с помощью вертикальных и горизонтальных рулей, установленных за гребным винтом на крестообразном кронштейне и имевших тросовый привод, проложенный в надстройке.
В четвертом отсеке длиною 3,2 и размещались дизель, главный гребной электродвигатель, расходные топливные цистерны, запасы масла и компрессор воздуха высокого давления. Палуба надстройки в районе входных люков имела уступ высотою 0,4 м.
Основным оружием подводных лодок были два сбрасываемых заряда взрывчатого вещества весом по две тонны каждый, размещаемые в прочных металлических контейнерах, установленных по каждому борту. Контейнеры имели плавучесть, близкую к нулевой, обеспечиваемую отсеками плавучести, и отделялись с помощью специального устройства, управляемого из прочного корпуса. Подрыв зарядов производился взрывателем с часовым механизмом, включение которого осуществлялось также из прочного корпуса.
Накопленный в боевых действиях опыт, а также выявленные недостатки были учтены при создании в 1943–1944 гг. новой серии сверхмалых подводных лодок из 12 единиц. Шесть из них, имевших наименование "Х20 — "Х25", не отличались по конструкции и общему расположению от подводных лодок предыдущих серий и использовались в боевых операциях, а остальные шесть лодок "ХТ1 — "ХТ6" использовались только для подготовки экипажей.
Необходимость создания специальных тренировочных подводных лодок была обусловлена тем, что большинство подготавливаемых членов экипажей, в том числе и командиры, не только впервые имели дело с подводной лодкой и ее оборудованием, но и часто впервые попадали на море. Полезный объем прочного корпуса на лодках "ХТ1 — "ХТ6" удалось увеличить за счет отказа от устройства для подъема перископа, поворота шахты РДП, коек экипажа, что позволило принимать на борт одного-двух инструкторов. Для обеспечения безопасности обучающихся на палубе надстройки этих лодок имелось постоянное леерное ограждение.
Строительство новой серии сверхмалых подводных лодок из 12 единиц ("ХЕ1 — "ХЕ12"), предназначенных для действий на Тихом океане, было закончено в ноябре 1944 г. Их особенностями являлись наличие улучшенного навигационного комплекса, радио — и телефонной связи, кондиционирования воздуха и некоторые другие улучшения.
Первые два отсека по их насыщению и объему остались практически такими же, как и на лодках предыдущих серий, за исключением установки на кормовой переборке второго отсека иллюминатора для наблюдения за членами экипажа, проходящими шлюзование.
В третьем отсеке размещался центральный пост управления лодкой. Для высвобождения объема внутри прочного корпуса некоторые контрольные и измерительные приборы были малогабаритными (авиационными). На подволоке отсека был установлен иллюминатор для визуального контроля момента прохода подводной лодки под днищем атакуемого корабля.
В четвертом отсеке размещались дизель, гребной электродвигатель, компрессор воздуха высокого давления, установка кондиционирования воздуха, баллоны с воздухом высокого давления, а в кормовом обтекателе прочного корпуса — дифферентная цистерна. В носовой оконечности располагались цистерна главного балласта N 1, буксирное и швартовное устройства. Проницаемая надстройка имела в поперечном сечении прямоугольную форму. Палуба была с небольшими скатами в носу и в корме. Для облегчения прохода через сетевые заграждения палуба лодки была гладкой, а все устройства выполнены заваливающимися и расположены по бортам надстройки.
В средней части подводной лодки по левому борту была установлена шахта РДП, заваливающаяся с помощью привода из прочного корпуса. Скорость хода в режиме РДП составляла 6 узлов на глубине 2 метра.
В Англии в начале 1952 г. в строю находилось пять сверхмалых подводных лодок серии "ХЕ", а к 1954 г. осталась только одна. В связи с этим акционерному обществу "Виккерс-Армстронг" была заказана пятая серия сверхмалых подводных лодок из четырех единиц "Х51 — "Х54", представляющих незначительную модификацию лодок серии "ХЕ". Отличались они от лодок серии "ХЕ" установкой постоянной тумбы перископа, возвышавшейся над палубой надстройки на 1,7–1,9 м, стационарной антенной радиосвязи и увеличением экипажа до пяти человек (из них три офицера).
Лодки вступали в строй начиная с первого октября 1954 г. с интервалами в три месяца. Предназначались они для диверсионных действий.