Все это произвело на Зиберта достаточно сильное впечатление, чтобы он принял предложение Гелена. Были собраны архивы и члены штаба, и Гелену позволили образовать "штабную ячейку Гелена" — сначала в секции исторических исследований, а затем в разведывательном центре 7-й армии в Висбадене. Их основная работа состояла в подготовке истории и анализа немецких разведывательных операций в Советском Союзе. Они также готовили сводки о советском танковом производстве, местоположении, силе и составе советских дивизий, как и о моральном духе Красной армии и советского населения.
Зиберт, убежденный в ценности Гелена, стремился получить одобрение военного министерства на учреждение разведывательной службы под управлением Гелена, ориентированной на Советский Союз. Посоветовавшись с Уолтером Беделлом Смитом, эйзенхауэровским начальником штаба (а в будущем и директором ЦРУ), он известил о своем открытии военное министерство.
Этого было достаточно, чтобы заинтересовать военное министерство настолько, что в августе 1945 года Гелен вместе с пятью коллегами отправился в Вашингтон. По прибытии в начале сентября Гелен встретился с начальником отделения стратегических служб (Strategic Services Unit) бригадным генералом Джоном Р. Магрудером и начальником армейской разведки генерал-майором Джорджем В. Стронгом. Но ни тот ни другой с ходу не предложили финансировать деятельность Гелена.
Лишь в феврале 1946 года, все еще во время пребывания Гелена в Соединенных Штатах, нежелание армии одобрить его предложение сошло на нет. В этом месяце советские войска оккупировали Северный Иран, что и с точки зрения американской общественности, и с точки зрения руководства страны являлось актом неприкрытой агрессии. Предположения Гелена о намерениях Советов обрели куда более правдоподобный вид.
В июле Гелен вернулся в Германию, чтобы под надзором американцев учредить близ Оберурзеля разведывательную организацию. Проект должен был осуществляться лишь в ограниченных масштабах на экспериментальной основе. По прибытии Гелену пришлось отразить выпад Бауна, в отсутствие Гелена убедившего Зиберта позволить ему восстановить "Walli I" под своим началом.
Как только притязания Бауна были отвергнуты, организация Гелена перешла к действиям, добившись серьезных успехов в операции "Богемия" летом 1948 года — когда волнения в Чехословакии, оказавшейся под властью Советов, позволили агентам Гелена успешно подговорить начальника западногерманского отдела чешской разведки дезертировать, забрав с собой массу архивов. В итоге результативность чешской разведки в Западной Германии снизилась практически десятикратно.
Но положение группы Гелена оставалось весьма шатким. Многие представители американской армейской разведки (G-2) по соображениям политики и безопасности возражали против поддержки немцев. В результате G-2 попыталась уговорить Центральную разведывательную группу (CIG) взять службу Гелена под свой контроль и финансовую опеку. Поразмыслив над предложением, CIG отклонило его.
Однако в сентябре 1948 года ЦРУ и вооруженные силы согласились провести совместные исследования и лишь после этого принять окончательное решение по поводу судьбы Гелена и его службы. Основную работу проделал агент ЦРУ Джеймс Критчфилд, после двухмесячных исследований передавший в штаб-квартиру ЦРУ телеграмму из двух тысяч слов. Критчфилд подчеркнул, что организация Гелена уже прочно обосновалась, располагает четырьмя тысячами работников и не годится для расформирования и подлаживания под другие нужды США. Имеется только две возможности, информировал Критчфилд, — ликвидировать организацию или взять ее под контроль.
Далее он доказывал, что сохранение службы под контролем США — более предпочтительный вариант. Со временем возникнет суверенная Германия, со своей собственной разведывательной службой, и Соединенным Штатам лучше принимать участие в руководстве и контроле над ней как можно дольше.
Критчфилд также рекомендовал более детально изучить организацию, узнать побольше о ее деятельности и достоинствах. В ответ ЦРУ назначило его контролером службы, дав ему два года на осуществление детального расследования. В то же самое время начались переговоры между Критчфилдом и Геленом. После множества затяжных дискуссий они сошлись на том, что запросы на информацию, направляющие деятельность организации, будет формулировать ЦРУ. Кроме того, к начальнику каждого отдела будет прикреплен офицер ЦРУ, а все донесения и подготовленные прогнозы и сводки будут поступать в ЦРУ.
Требование сообщить имена полевых агентов организации вызвало, пожалуй, самые сильные разногласия. Гелен, поначалу наотрез отказывавшийся предоставить сведения, в конце концов согласился на компромисс, открыв имена 150 старших членов своей организации, но благодаря финансовому давлению, личным контактам и дискуссиям о конкретных проектах Соединенные Штаты смогли узнать о сотрудниках Гелена намного больше.