Между прогнозом от 19 октября и объявлением карантина президентом Кеннеди 22 октября сбор разведданных, конечно, продолжался с лихорадочной поспешностью. Полеты U-2 показывали, что в строй сданы еще две пусковые площадки баллистических ракет средней дальности, так что общее число их достигло четырех, и еще две будут боеспособны к концу недели. Снимки показывали также, что в Сан-Хулиане собрано еще как минимум 35 бомбардировщиков Ил-28. Снимки и, вероятно, данные электронной разведки также указывали, что 22 из 24 пусковых площадок СА-2 на Кубе боеспособны. На снимках были видны также бункеры для хранения ядерных боеприпасов, хотя распознать ни одной ядерной боеголовки не удалось.
Речь президента Кеннеди не повлияла на разведывательную деятельность США во время ракетного кризиса, во всяком случае в отношении ее основных объектов Кубы, открытого моря и Советского Союза. Но теперь следовало учитывать и новые факторы. Как отреагируют Советы, теперь столкнувшиеся с всемирной оглаской их деятельности и блокадой США: будут ли они продолжать прежние действия, заморозят или демон тируют пусковые площадки? Повернут ли советские корабли, находящиеся в открытом море, или попытаются пробиться сквозь блокаду? Отдаст Хрущев вкупе с прочими советскими вождями приказ о переводе советских ядерных и прочих войск на повышенную боеготовность? В последующие шесть дней американские спецслужбы стремились отыскать ответы на эти вопросы. Полученные данные оказались запутанными и неясными. Поздно вечером 23 октября NSA донесло, что результаты пеленгации (на самом деле проводившейся военно-морской группой безопасности) указывают, что не менее пяти советских судов, направлявшихся к Кубе с ракетами на борту, изменили курс и, вероятно, возвращаются в Советский Союз. И хотя ВМФ не мог проверить достоверность сведений до наступления светлого времени суток, они настолько убедили дежурного офицера ЦРУ, что он разбудил директора Маккона, чтобы поведать ему эти новости. На следующий день стало ясно, что 16 из 18 советских судов, часть из которых имели большие люки, либо повернули, либо легли в дрейф.
Что же касается событий в Советском Союзе, 23 октября ЦРУ донесло: "В течение первых часов после речи президента мы не обнаружили никаких признаков необычной активности или подъема советских войск по тревоге". 25 октября Наблюдательный комитет рапортовал, что состояние боеготовности советских вооруженных сил повышено. На следующий день комитет заметил, что, хотя Советы и перешли на повышенную боевую готовность, нет никаких явных признаков значительного развертывания войск. Подобные суждения, несомненно, основывались в первую очередь на прослушивании Соединенными Штатами советских военных переговоров.
23-24 октября наблюдения NSA за Кубой также выявили появление двух новых скремблированных линий связи, хотя и не смогли выявить их точного местоположения. И хотя невозможно было определить, организованы ли эти линии для поддержки пусковых площадок, в после-кризисных исследованиях отмечалось, что они "отвечали требованиям системы связи развернутых на Кубе наступательных ракетных подразделений, будучи и весьма устойчивыми к взлому, и способными справиться с большими потоками переговоров".
Однако фотографии, запечатлевшие развитие ситуации на Кубе, дали президенту и его советникам повод для беспокойства. Фотографии показывали, что некоторые виды работ на дополнительных пусковых площадках продвигаются довольно быстро — даже быстрее, чем раньше. 27 октября снимки показали, что все шесть пусковых площадок БРСД боеспособны, и полное число позиций составило 24 с потенциалом запуска 48 ракет за два залпа. Кроме того, плановые снимки показали, что две площадки БРПД будут боеспособны в декабре. И, наконец, на фотографиях за 25 октября были видны два собранных бомбардировщика Ил-28, сборка еще трех, а на аэродроме в Сан-Хулиане стояли ящики с комплектующими еще двадцати бомбардировщиков.
Затем, 28 октября, информационная служба зарубежного радиовещания ЦРУ (Foreign Broadcast Information Service) известила Белый дом, что "московское радио в России в 14.04 по Гринвичу 28 октября передало обращение Хрущева к президенту Кеннеди, сообщавшее, что СССР решил демонтировать советские ракеты на Кубе и вернуть их в Советский Союз 28 октября".