Военный талант Ушакова удачно дополнялся незаурядными административными и дипломатическими способностями, позволявшими ему самостоятельно и со знанием дела решать нелегкие задачи и проблемы в сложной обстановке происков и скрытного противодействия союзников — англичан, австрийцев, турок.
Дальнейшая судьба выдающегося флотоводца сложилась не столь удачно. Его замечательные боевые победы и огромные заслуги перед Россией и ее флотом не получили должного признания у царствующего двора. Более того, при новом императоре Александре I и его окружении Федор Федорович, как и другие передовые военные деятели, оказался в опале. Он был отозван в Петербург и назначен главным командиром уже отжившего Балтийского гребного флота и начальником флотских команд в столице.
Глубоко обиженный, тяжело переживавший запустение и разложение флота, Ушаков в конце 1806 года подает прошение об увольнении со службы. 17 января 1807 года он получает отставку.
Во время Отечественной войны 1812 года отставного адмирала избирают начальником тамбовского народного ополчения, но в ту пору он уже был тяжело болен. Оставаясь верным заботе о простых людях, Федор Федорович жертвует в фонд лечения раненых и больных воинов и в помощь пострадавшим в войне свои сбережения. Передал он также для нужд борьбы с врагом бриллиантовый челенг и пушки, подаренные турецким султаном.
Умер Федор Федорович Ушаков в конце сентября 1817 года, похоронили его 2 октября в Санаксарском монастыре, неподалеку от его деревеньки Алексеевки Темниковского уезда. На могиле адмирала установлен памятник — мраморная колонна. На ней выбиты слова: «Здесь покоится прах его высокопревосходительства и высокопочтенного болярина флота адмирала и разных российских и загранных орденов кавалера Федора Федоровича Ушакова, скончавшегося 1817 года сентября на 74 году от рождения»[68].
Имя выдающегося русского флотоводца глубоко чтимо в нашей стране. В 1944 году Президиумом Верховного Совета СССР были учреждены военный орден Ушакова I и II степени и медаль Ушакова, которыми награждаются военные моряки за боевые заслуги. Его имя носит один из крупных кораблей Военно-Морского Флота.
Боевая слава Черноморского флота, родившаяся в победоносных сражениях, проведенных Ф. Ф. Ушаковым, приумножалась новыми поколениями русских и советских военных моряков. А в водах Средиземного моря, где двести лет назад плавала ушаковская эскадра, ныне советские корабли несут боевую вахту мира и безопасности социалистической Родины.
Иллюстрации