Оставив флот, поступил на гражданскую службу всё в то же АНБ, и в 1967 году получил в Стэнфордском университете (Калифорния) степень доктора философии. Вскоре вышел в отставку и в 1972 году поступил на работу в Стэнфордский исследовательский институт - филиал университета, образованный с целью проведения засекреченных исследований для оборонной промышленности и разведки США. Основной областью научных интересов Путоффа в тот период являлись лазеры. Именно в Стэнфордском исследовательском институте Путофф разработал для ЦРУ и Разведывательного управления Министерства обороны (РУМО) США программу дистанционного наблюдения, которая стала ядром засекреченных исследований, проводившихся в институте на протяжении 1972-1985 годов.
Переход от лазеров к дистанционному наблюдению, как следовало из рассказа Путоффа Куку, произошёл в начале 1970-х годов, когда физики активно занимались поисками тахионов - частиц, которые теоретически могли передвигаться быстрее скорости света. Обнаружить их было крайне сложно именно по той причине, что они не передвигались со скоростью, меньшей скорости света.
Тогда же Путофф прочитал книгу «Открытия в области сверхъестественного за железным занавесом», в которой говорилось о том, что учёные в СССР активно ищут доказательства существования экстрасенсорных способностей в растительном мире. В книге описывались некоторых из таких опытов: учёные прикрепляли пару растений, которые находились на огромном расстоянии, к полиграфам, и защищали растения от воздействия электромагнитных волн. В ходе экспериментов выяснилось, что когда одно растение прижигали сигаретой или кто-то начинал думать о нём, другое растение отвечало, что и фиксировали датчики полиграфа.
Так как одно из предполагаемых свойств тахионов заключалось в способности преодолевать любые препятствия, Путофф решил, что было бы резонно обратиться к поиску тахионов в органических живых системах. С помощью известного в США медиума Инго Сванна (Ingo Swann) он провёл серию экспериментов, в ходе которых Сванн подробно описывал абсолютно незнакомые ему предметы, которые находились в закрытых помещениях.
Вскоре после этого Путофф получил предложение от ЦРУ принять участие в закрытой исследовательской программе, целью которой было удостовериться, действительно ли, с технической точки зрения, представляется возможным использовать ясновидение для проведения разведывательных действий в СССР. Причиной такого интереса руководства ЦРУ к ясновидящим, телепатам и медиумам крылась в том, что это разведывательное ведомство в течение ряда лет внимательно следило за попытками советских учёных проделать то же самое, но очень сомневалось в том, что это в принципе возможно. После того, как ЦРУ изучило аналитический доклад, подготовленный Путоффом по этой теме, он был назначен директором программы США по наблюдению на расстоянии. Изначально программа называлась «Project SCANATE», а ближе к своему окончанию была переименована в «Звёздные врата» («Star Gate»).
Результаты этой программы Ник Кук описывает следующим образом:
«В течение следующих полутора десятков лет(речь идёт, судя по всему, о второй половине 1970-х - 1980-х годах; чуть ниже будет объяснено, почему - Consp.) американские “шпионы-ясновидящие” наводнили СССР, используя силу собственного разума для обнаружения самых засекреченных объектов. Если поверить тому, что было написано в отчётах о деятельности этих людей, то они могли путешествовать не только в трёх измерениях - вверх-вниз, влево и вправо, но и в четвёртом измерении: во времени. Они могли возвращаться назад для наблюдения за своими мишенями и также могли видеть их в будущем.Путофф показал мне картинку, нарисованную одним из таких медиумов: там был изображён “неизвестный исследовательский центр в Семипалатинске”, в котором занимались разработкой советского ядерного оружия. Потом он показал мне рассекреченные фотографии того же самого объекта, сделанные со спутника. Они были практически идентичны»
.