Вскоре после отбытия послов Александр вторгся в Финляндию и, разгромив шведов в яростной битве, обложил страну данью. В этих и всех остальных битвах, где сражались дружины Новгорода, Киева и Полоцка, они бились с именем святой Софии на устах, поскольку именно ей были посвящены главные соборы в этих городах; а войска Владимира, Ростова, Смоленска и Москвы бились во имя Богоматери или Святой Троицы. Древние князья Руси после обращения в греческую религию взяли своим гербом три круга в треугольнике, в одном из которых написана Троица, во втором – имя правящего князя, а в третьем – его титулы.
Признание Даниилом Галицким главенства римской церкви было лишь временной уловкой, ибо, узнав, что Иннокентий совершенно не в состоянии оказать никакой помощи в борьбе с монголами, притом что под предлогом изгнания нечестивых захватчиков его владения постоянно разоряют поляки, венгры и чехи, чьи грабежи были немногим лучше хищнических набегов татар, он решил примириться с константинопольской церковью и другими князьями Руси и, послав местного священника Кирилла к изгнанному патриарху в Никею, попросил назначить его посланца киевским митрополитом. Патриарх с радостью принял заблудшего сына и выполнил его желание. Кирилл митрополитом вернулся на Русь и проехал по всей империи, восстанавливая разрушенные церкви и назначая епископов во многие пустовавшие епархии. Один из назначенных им епископов – Феогност – впоследствии отправился с тайным посольством в Рим по поручению Менгу-Тимура, преемника хана Берке.
В 1253 году, по возвращении Александра из второго путешествия в Каракорум, на некотором расстоянии от своего нового Владимирского княжества его встретило шествие с Кириллом во главе, который поздравил князя с возвышением; перенеся свой престол во Владимир, Александр поставил править Новгородом своего сына Василия. Но когда Берке обложил всю Русь данью, в том же году, когда китайские монголы обложили данью Поднебесную, новгородцы восстали против своих безжалостных притеснителей и выгнали всех сборщиков дани и ханские гарнизоны. Тогда Александр лично выступил против них с войском из Владимира и подавил восстание. Его сын бежал в Псков, и великий князь, боясь поставить себя под удар в глазах бояр милостью к мятежникам, велел казнить всех восставших горожан с величайшей суровостью, а зачинщиков ослепить и вырвать им ноздри; и такой жестокостью и раболепием вернул себе и своей семье благоволение хана, который был готов при малейшем признаке непокорности вторгнуться на Русь со своими ордами и снова превратить ее в бесплодное пепелище. В то же время Менгу издал указ о том, что всякий русский, который будет не в состоянии заплатить за себя обременительную дань, должен быть продан в рабство. Строгое соблюдение этого указа погрузило империю в неописуемые беды; и в 1260 году разразилось новое восстание против татарской власти, в ходе которого русские расправились почти со всеми монгольскими откупщиками дани. Великий князь снова усмирил мятеж, но он столь разгневал императора монголов, что Александру, дабы очиститься от всех подозрений в каком-либо потворстве или поощрении этого нового восстания своих недовольных подданных, пришлось снова приехать в Орду и принести новую присягу верности Хубилаю, который незадолго до того сменил своего брата, императора Мункэ. Но на обратном пути он заболел, как и его отец, и умер, как полагали, от яда, и, по тогдашнему обыкновению России, на смертном одре он принял монашеский постриг. Александр был женат на дочери полоцкого князя и имел от нее четверых сыновей: Василия, Дмитрия, Андрея и Даниила; он скончался 14 ноября 1263 года, и его останки были погребены в Богородице-Рождественском монастыре во Владимире, где после причисления его к лику святых несколько лет спустя его могилу ежегодно посещали многие паломники. Спустя почти четыреста пятьдесят лет после его смерти Петр Великий, чтобы примирить подданных со своей недавно основанной столицей Санкт-Петербургом, приказал перенести останки Александра с клязьминских берегов на невские и положить в великолепную гробницу в Александро-Невском монастыре, где они остаются по сию пору, а также учредил орден, названный его именем. Александра сменил его брат Ярослав, князь Тверской.