Одной из особенностей структуры главка, учитывавшей состояние войны, являлось наличие при его руководителе института помощников, состоявшего из сотрудников, как правило, в звании генералов. Они выполняли кураторские функции в отношении деятельности управлений контрразведки Смерш фронтов. Напомню, что в июле 1943 года с учетом стратегической обстановки имелось двенадцать фронтов, а на завершающем этапе войны их осталось восемь.
Как вытекает из рассмотренной структуры, аппарат Смерша имел в своем арсенале все необходимые оперативные и технические средства, позволявшие автономно и быстро, без бюрократических проволочек решать весь сложный комплекс контрразведывательных и разведывательных задач, ни у кого и ничего не прося.
С учетом подчинения военной контрразведки Народному комиссариату обороны в аппарате Смерша вместо партийного комитета был образован политотдел. Он состоял всего из двух человек: начальника — полковника Сиденькова, пришедшего в контрразведку из бронетанковой академии, и секретаря-машинистки.
Штат аппарата главка Смерша с учетом масштабов Великой Отечественной войны, противостояния военной контрразведке значительных сил германских спецслужб являлся сравнительно небольшим, компактным и мобильным — насчитывал 646 человек. В аппарате хорошо сочетались кадры зрелых профессионалов, офицеров, прошедших испытания в сражениях начального периода войны, и рвущейся в бой молодежи.
На должностях оперативного и технического состава довольно успешно служило немало женщин. Многие из них имели офицерские звания. Заместителем начальника отдела кадров, например, работала полковник Егорова.
Сотрудники Смерша имели общевойсковые звания и носили форму армейского образца.
Начальником ГУКР НКО Смерш Совнарком назначил В. С. Абакумова, тридцатипятилетнего контрразведчика-профессионала. Заместителями Абакумова были утверждены П. Я. Мешик, Н. Н. Селивановский и И. Я. Бабич, а несколько позже И. И. Врадий. До прихода в аппарат Смерша Селивановский и Бабич, соответственно, руководили особыми отделами Южного и Северо-Западного фронтов.
Размещался личный состав аппарата Смерша главным образом в доме два на площади Дзержинского, ныне Лубянской, занимая четвертый и седьмой этажи.
Совнарком СССР поставил Смершу ответственные задачи: вести борьбу со шпионской, диверсионной, террористической и иной подрывной деятельностью иностранных разведок в частях и учреждениях Красной армии; принимать необходимые агентурно-оперативные и другие (через командование) меры, обеспечивающие непроницаемость линии фронта для шпионских и антисоветских элементов; бороться с предательством и изменой Родине, дезертирством и членовредительством на фронте и в частях; осуществлять проверку военнослужащих и других лиц, бывших в плену и окружении противника; выполнять специальные задания народного комиссара обороны.
Свои задачи военная контрразведка решала в тесном взаимодействии с подразделениями органов государственной безопасности, Наркоматом внутренних дел, пограничниками и партизанским движением.
Руководители и сотрудники органов Смерша в центре и на местах представляли единое целое со всей системой Наркомата обороны, строго руководствовались воинскими уставами, наставлениями и ведомственными приказами, постоянно поддерживали дисциплину, порядок и субординацию. Сотрудники, сражавшиеся на фронтах, несли на себе все тяготы и лишения войны, нередко непосредственно участвуя в боевых действиях. Органы военной контрразведки и армию объединяла, сплачивала единая цель — быстрее одолеть гитлеровских захватчиков, добиться окончательной победы. В целом, реформа военной контрразведки прошла организованно, быстро и безболезненно.
Прошло более шестидесяти лет с образования органов Смерша. Давно их деятельность ушла в историю. Не стало Советского Союза. Изменились Россия и ее специальные службы. И все же иногда задают вопрос: «Был ли оправдан риск реорганизации военной контрразведки в самый разгар войны с фашистской Германией? Не было ли ошибкой переподчинение контрразведки Наркомату обороны?». Думается, что на этот вопрос уже дала ответ сама история — итоги Великой Отечественной войны. Они подтвердили разумность и своевременность реформы военной контрразведки. Органы Смерша действовали против абвера и других гитлеровских спецслужб высокоэффективно. Поэтому нельзя исключать, что при возникновении острых ситуаций подчинение контрразведки военному ведомству может оказаться целесообразным.