Родился он в городе Троицке Челябинской области — татарин по национальности. Отец умер, когда Исхаку было несколько месяцев. Мать вместе сыном поселилась у своего отца, который был кустарем-скорняком. В 1912 году скончался и дед. Пареньку пришлось «пойти в люди» — податься в батраки. Получив среднее образование, он поступает в Коммунистический университет народов Востока. После — на факультет международных отношений Первого государственного университета (ныне МГУ. —
В 1932 году он уже сотрудник ИНО ОГПУ и после непродолжительной стажировки НКИД направляется в командировку в Турцию под прикрытием секретаря генерального консульства СССР в Стамбуле. Потом он работал в Трапезун-де (Трабзоне). В 1934 году Ахмерова направляют на нелегальную работу в Китай, куда он прибыл по чужим документам через Европу. Под видом турецкого студента он поступил в американский колледж для иностранцев в Пекине. Для него это была удачная «крыша».
Через несколько лет, в 1935 году, его назначают на нелегальную работу в США. Он проводит там ряд блестящих вербовочных операций, приобретая агентуру, в том числе и из высокопоставленных чиновников.
Второй раз в США он был в период с 1942 по 1945 год, возглавляя новую нелегальную резидентуру, жил под псевдонимами Билл Грейнке, Майкл Грин и Майкл Адамец. Ахмеров и его супруга в Америке отработали блестяще. Только за годы войны они переправили в СССР 25 тысяч пленок с секретными материалами. Они прекрасно разбирались в тонкостях внутриполитической обстановки в США.
Итак, после 12-летнего пребывания за рубежом на нелегальной работе в 1 945 году возвратился на Родину и был назначен заместителем начальника отдела нелегальной разведки. Выполняя поручения руководства разведки, выезжал в краткосрочные командировки в различные страны. Проводил операции по восстановлению утраченной связи с агентами-нелегалами. Выполнял другие ответственные задания по линии внешней разведки.
Умер И. А. Ахмеров в 1975 году.
Открытие мемориальной доски в честь 110-летия со дня рождения легендарного советского разведчика состоялось 7 апреля 2011 года.
Кроме русского Ахмеров прекрасно владел татарским, турецким, английским и французским языками. За выполнение специальных заданий по линии нелегальной разведки полковник Ахмеров награжден двумя орденами Красного Знамени, орденом «Знак Почета» и многими медалями. Ему также было присвоено высокое звание «Почетный сотрудник Госбезопасности СССР».
Говоря о разведчиках подобного масштаба, хочется заметить, что Кремль не особенно привечал их во все времена. Что касается отношения Сталина к разведке и разведчикам, то об этой стороне деятельности вождя еще мало написано.