Ровно год спецназ «Омега» будет работать в провинциях Афганистана и нести нелегкую боевую службу в мелких гарнизонах и крепостях Афгана, перехватывая на горных тропах караваны с оружием, вступая в ночные схватки с бандами душманов, наводя советские самолеты на засекреченные объекты врага. Весь накопленный за годы афганской войны опыт «каскадеров» был учтен в оперативно-боевых операциях спецназа «Омега». Командирами спецгрупп спецназа «Омега» были опытные командиры «Зенита» и «Каскада».
В своей деятельности спецназ «Омега» подчинялся заместителю начальника внешней разведки КГБ генералу Ю. И. Дроздову, начальнику Спецотдела генералу Н. В. Ефимову и сменившему его на этом посту генералу В. К. Толстикову, а также — по оперативной линии — командиру «Вымпела» капитану 1-го ранга Э. Г. Козлову.
Главной боевой задачей спецназа «Омега» было ведение инструкторской и советнической деятельности в афганских силовых структурах, ведение агентурно-оперативной работы в интересах Центра и сопровождение боевых операций спецназа.
Вспоминает старший офицер спецназа «Омега», начальник информационно-аналитического отдела спецназа, полковник в отставке Савицкий Олег Анатольевич:
«За год служебной командировки в ДРА информационно-аналитической группой отряда “Омега” была проделана большая работа. Из каждой зоны ответственности в Кабул регулярно поступали отчетные, плановые, рабочие и срочные материалы, отражающие состояние борьбы с вооруженной контрреволюцией. Вся информация перерабатывалась и в обобщенном виде направлялась в Центр, а наработанные на ее основе рекомендации распространялись в порядке обмена опытом между подразделениями других зон и использовались как в подготовке афганских оперативно- боевых подразделений, так и при проведении ими боевых операций. Нашли применение и варианты реализации оперативной информации через возможности 40-й армии.