В 1717 году Скоропадский снова просил государя о разных облегчениях для Малороссии. Царь в 1719 году дал ответ, в котором вместо ожидаемых милостивых льгот заметил, что великорусский народ при строительстве современного государства несет разные тягости в податях и в людях и во всем прочем, а малороссийский народ по царской милости не знает таких тягостей, не принимая участие в совершенствовании страны.
В следующем, 1720 году царь указал Малороссии, что ей необходимо готовиться не к новым льготам и не обосабливаться от прочих частей государства, а, напротив, теснейше соединяться со всеми частями России и участвовать во всех российских государственных делах. Надо делить все тяготы государственного строительства со всеми россиянами, а не отделяться от них.
Царь потребовал от гетмана выделить двенадцать тысяч казаков на строительство Ладожского канала. Старшина приуныли. Они привыкли воевать и возвращаться домой с богатой добычей. А им царь предлагал стать не воинскими добытчиками, а заняться строительством водно-морской сети каналов для создания водного пути между Белым морем и Балтийским. Он был нужен для поднятия экономики страны.
Запорожские казаки не понимали этого и не хотели этого понять. Историю Древней Руси они не знали. Мало кто из них слышал о древнем купеческом пути «из варяг в греки». Благодаря ему возник стольный град Киев. Когда прекратился путь «из варяг в греки», исчезли торговые связи Севера Европы с Византийской империей по Днепру, разрушилась экономика Киева, не стало преуспевающего стольного града.
Жалобы к царю сыпались со всех слоев населения Малороссии. Низы не хотели выполнять приказы своих полковников, посылавших своих представителей с новыми денежными поборами. Казацкая верхушка не видела смысла в рытье Ладожского канала, не приносившего им прибыли. И все таки Павел Полуботок отправился с десятью тысячами казаков на Ладогу
В 1722 году приехал гетман Скоропадский в Петербург за новой царской милостью. Вместо нее получил царский указ о создании в Малороссии параллельно с гетманством Коллегии с царскими чиновниками, которые должны были ограничить права гетмана. Эта коллегия должна была войти в общую систему учрежденного еще в 1719 году коллегиального управления по всей России.
Гетман не захотел понять, что Украина становится неотъемлемой частью централизованного государства. Заявил Петру I о вольностях, гарантированных договором, заключенным Богданом Хмельницким с московским царем. В ответ Петр I в свою очередь указал Скоропадскому о незнании им текста договора.
Скоропадский договор не читал и не слышал о таком пункте договора, на какой указывал Петр, и во всей Малороссии не знали и не слышали, чтобы Переяславский договор давал право великорусским воеводам встревать во внутренние дела Малороссии. Скоропадский промолчал и уехал на родину со смертельною раною в сердце. Он жил недолго.
После смерти Скоропадского гетманский пост остался незанятым. Надобно было избрать нового главу малороссийского казачества по указу императора. Но у Петра I были другие неотложные дела. Он готовил поход в Персию. Понимая, что указа ждать долго, казаки без соизволения императора избрали временным, то есть наказным гетманом черниговского полковника Павла Полуботка.
Временное малорусское гетманское правительство отправило своих посланцев Рубца и Быковского в Петербург, в сенат с челобитной: просим назначить выборы настоящего гетмана.
Вот тут-то и заварилась «каша». Петр I, получив одновременно прошения наказного гетмана о новых льготах и о самоуправстве президента Малороссийской коллегии Вельяминова, наотрез отказался проводить выборы нового гетмана. Он заявил: (цитирую по очерку Н. Костомарова «Павел Полуботок», журнал «Русская старина», том XVI, 1876 год):
«Всем ведомо, что с Богдана Хмельницкого до Скоропадского все гетманы явились изменниками, от чего много потерпело государство Русское, особенно Малороссия, и потому надобно приискать в гетманы верного и надежного человека, а пока такой найдется, определено правительство, которому надлежит повиноваться и не докучать насчет гетманского выбора».
Это малороссийское правительство, на которое указывал Петр, была Малороссийская коллегия, до крайности ненавистная для малорусских начальственных людей. Между нею и генеральною старшиною произошло тогда жестокое столкновение. Старшина толковал, что коллегия должна была производить только дела по апелляциям, поданным на приговор генерального суда; старшина находил несправедливым, что коллегия разбирает всякие дела, даже не бывшие в генеральном суде, и берет на себя право делать распоряжения мимо туземной (так написано у Костомарова – С.А.) власти.
Главные распри, что произошли тогда между коллегиею и старшиною, были связаны с тем обстоятельством, что коллегия по приказу государя оповестила универсалом по всей Малороссии, чтобы все, которые имеют какое-нибудь неудовольствие против старшин и какого бы то ни было начальства в Малороссии, подавали жалобы в коллегию».