Развитие фолликулов в яичниках кобыл идет под влиянием гормонов передней доли гипофиза. Физиологически сложившееся соотношение между этими гормонами обусловливает свойственные виду сельскохозяйственных животных особенности овуляции. У кобыл нет определенной связи между началом охоты и временем овуляции: она может наступить в любой день охоты. Наиболее доступным способом определения состояния яичников кобыл является ректальное исследование, которое проводит зооветеринарный персонал, прошедший специальную подготовку.
Оплодотворение – слияние спермиев с яйцеклеткой – происходит в верхней части яйцевода. Во время первых делений оплодотворенная яйцеклетка находится еще в яйцеводе, а к концу примерно шестых суток она поступает в матку. Питание зародыша обеспечивается частично самой цитоплазмой, частично секретом матки («маточное молоко»), который резорбируется (всасывается) наружным слоем зародыша – трофобластом. Дальнейшее развитие зародыша характеризуется более высокими требованиями к питанию, дыханию и выделению продуктов обмена. Эти требования удовлетворяются образованием плаценты, которая становится посредником между кровообращением плода и матери. Ворсинки хориона со слизистой оболочкой матки у кобыл соединяются поздно.
Имплантация плода представляет собой ступенчато прогрессирующий процесс, происходящий в период от 8-й до 14-й недели. Связь плода с маткой у кобыл значительно менее прочна, чем у жвачных животных. У лошадей на хорионе образуются ворсинки, которые имеют разветвления и входят в разветвленные углубления слизистой матки. При рождении жеребенка ворсинки хориона просто вытягиваются из крипт (углублений слизистой матки), не вызывая ее повреждений и разрыва кровеносных сосудов. Этим объясняется тот факт, что у лошади случаи задержки последа бывают гораздо реже, а выкидыши – сравнительно чаще, чем у жвачных.
Оплодотворенная яйцеклетка (зигота) в половых органах кобылы совершает значительные перемещения (миграции плода). Созрев в левом яичнике, яйцеклетка после оплодотворения может прикрепиться к слизистой оболочке правого рога. У значительной части кобыл (60%) единичные овуляции происходят в левом яичнике, но беременность у большинства из них (65%) развивается в правом роге. Рога матки также гетерохронны (неравноценны), как и яичники, с той только разницей, что в молодости функционально менее активным, как бы отстающим в своем развитии, является левый рог (а из яичников таким был правый). У 3–4-летних кобыл жеребость значительно чаще (60–75% случаев) протекает в правом роге. С возрастом кобыл активность левого рога увеличивается, но к старости правый рог матки чаще бывает рогом-плодовместилищем.
Первые половые циклы молодых кобыл часто протекают без овуляции. У полновозрастных кобыл при неблагоприятных условиях содержания также наблюдаются охота без овуляции и значительные нарушения полового цикла. Сильная и продолжительная охота кобыл, протекающая также без овуляции, является следствием патологических изменений в яичниках (воспаление, киста и др.). У кобыл некоторых местных пород наблюдается четко выраженная сезонность половых циклов, приуроченных к весеннему периоду года.