Члены конгресса США осуждали «слабую» декларацию Сан-Хосе. В то же время в ответ на эту декларацию в Гаване 2 сентября 1960 года состоялся массовый митинг, на котором выступил Фидель Кастро. В конце митинга его участники приняли так называемую Гаванскую декларацию. В ней осуждалась агрессивная политика США в отношении Кубы и провозглашались неотъемлемые права народов Латинской Америки. А вскоре Фидель Кастро прибыл на сессию Генеральной ассамблеи ООН, на которой выступил с речью. В ней он вновь разоблачал происки США по отношению к Кубе.
Тем временем вопрос о Кубе стал активно обсуждаться в ходе предвыборной кампании по избранию президента США. Кандидат от демократов Д.Ф. Кеннеди в своих выступлениях в теледебатах против кандидата от республиканцев Р. Никсона (23 сентября, 6 и 21 октября) обвинял республиканское правительство в том, что оно «упустило» Кубу, и требовал оказания помощи кубинской контрреволюции. Хотя Р. Никсон заявлял в ответ, что Куба — «это невыносимая раковая опухоль» и «терпение уже не является добродетелью», он осуждал позицию Кеннеди. Никсон говорил, что «если мы последуем этим рекомендациям, то мы потеряем друзей в Латинской Америке, нас, возможно, осудят в ООН, и мы не достигнем цели». Хотя Никсон прекрасно знал о начавшейся подготовке к вторжению на Кубу, он предлагал ограничиться экономической блокадой против острова.
19 октября Государственный департамент объявил о введении запрета на торговлю почти всеми товарами с Кубой. 16 декабря Д. Эйзенхауэр заявил о запрещении закупок кубинского сахара в первой половине 1961 года. Правительство Кубы 31 декабря 1960 года потребовало созыва Совета безопасности для осуждения агрессивных действий США. В ответ правительство США в первые числа января 1961 года разорвало дипломатические отношения с Кубой.
За два месяца до этого на президентских выборах США победу одержал Д.Ф. Кеннеди. Внешнеполитическая платформа нового президента была направлена на укрепление пошатнувшихся позиций США в Латинской Америке с помощью проведения более гибкой политики. Кеннеди предложил создать «Союз ради прогресса», что предусматривало оказание значительной американской помощи странам Латинской Америки для осуществления широких экономических и социальных преобразований. Пример Кубы заставлял правящие круги США маневрировать с тем, чтобы предотвратить новые революции в Западном полушарии.
Одновременно правительство Кеннеди поддержало планы своих предшественников из республиканской партии, предусматривавшие вооруженное свержение правительства Кастро. 17 ноября 1960 года директор ЦРУ Аллен Даллес сообщил Кеннеди о подготовке вторжения на Кубу. Кеннеди одобрил действия ЦРУ.
Через день после прихода к власти правительства Д.Ф. Кеннеди Фидель Кастро заявил о готовности нормализовать кубино-американские отношения. Кеннеди не ответил на эту инициативу. Подготовка к вторжению продолжалась. В апреле в правительстве США состоялось обсуждение последних деталей плана интервенции. ЦРУ настаивало на более активном вмешательстве Вооруженных сил США. Государственный департамент выступал за более ограниченные действия, опасаясь неблагоприятной международной реакции. Компромиссом между этими позициями стало решение президента США сократить предполагавшееся первоначально число бомбардировок Кубы (вместо 48 было решено осуществить 8).
15 апреля с ведома президента США кубинские контрреволюционеры начали бомбить Кубу. Через два дня вооруженные отряды контрреволюционных эмигрантов высадились на берегу залива Плайя-Хирон. Вторжение должно было сопровождаться диверсиями в тылу.
Вскоре после начала интервенции стало ясно, что разгром «контрас» неизбежен. Энергичные удары кубинской армии по интервентам, сопровождавшиеся решительными действиями внутри страны против засланных заранее диверсантов, сорвали тщательно разработанные планы. В течение 72 часов интервенты потерпели поражение. Более 1000 из них были взяты в плен.
В последние часы разгрома интервентов кубинский контрреволюционный совет во главе с Миро Кардона, а также ряд американских военачальников настойчиво требовали вооруженного вмешательства США. Хотя Кеннеди не уступил этому требованию, он согласился обеспечить прикрытие контрреволюционеров шестью реактивными истребителями с авианосца «Эссекс».