Натолкнувшись на сопротивление России и Китая в Совете безопасности, США решили действовать в обход ООН. 2 октября 1998 года государственный секретарь США Мадлен Олбрайт и премьер-министр Великобритании Антони Блэр объявили, что согласия ООН на акцию НАТО в Косово не требуется. Лидер албанских сепаратистов Ибрагим Ругова 3 декабря заявил, что он не пойдет на переговоры с руководителем Югославии Милошевичем, пока НАТО не начнет бомбить Сербию. 9 октября 1998 года руководство НАТО сообщило о достигнутой договоренности относительно действий в отношении Сербии. Генеральный секретарь НАТО Солана заявил о том, что НАТО начнет бомбить Сербию, если та не примет условия НАТО. В ответ Милошевич заявил, что готов принять все условия, за исключением требования ввести войска НАТО в Косово. Тогда специальный посланник президента США Холбрук заявил, что это требование является главным, с чем Милошевичу следовало согласиться.
23 марта Югославия отказалась подписать документ, ущемляющий ее суверенитет, и переговоры в Рамбуйе по урегулированию конфликта вокруг Косово были прерваны. В ночь с 24 на 25 марта 1999 года войска НАТО стали бомбить системы ПВО, аэродромы, военные заводы и армейские казармы Сербии и Черногории. В налетах приняло участие 300 самолетов. Кроме того, было выпущено 90 ракет.
Сообщали, что соотношение убитых среди военных к убитым среди гражданских лиц 1 к 10. Вокруг Белграда загорелся лес. Была взорвана фармацевтическая фабрика, и в городе опасались химического заражения. 3 апреля американцы бомбили центр Белграда. Было уничтожено шестиэтажное здание Министерства внутренних дел. 5 апреля сообщали о том, что в ходе бомбежек Белграда самолеты НАТО разбомбили ТЭЦ, обслуживавшую население в миллион человек. Предложения Югославии о временном прекращении огня по случаю Пасхи были отвергнуты Западом.
20 апреля сообщили, что в Албании стягивались американские войска. Бомбардировки Югославии продолжались. 22 апреля, за несколько часов до прибытия в Белград B.C. Черномырдина, который пытался играть роль посредника между Югославией и Западом, самолеты НАТО разбомбили резиденцию Милошевича. 23 апреля авиация НАТО уничтожила белградский телецентр. К.Г. Мяло писала: «Особое внимание уделялось разрушению хранилищ нефти и нефтепродуктов, а также объектов энергетики, которую, по мнению экспертов, агрессор вообще стремился вывести из строя, для чего были применены… графитовые бомбы. Они вызывали короткие замыкания, обесточившие целые города (Белград и примерно 70 % территории Сербии на много часов остались без электричества и водоснабжения»).
7 мая было разбомблено посольство Китайской Народной Республики. Несколько работников посольства и журналистов погибли. Как и при бомбардировке французского посольства в Триполи, американцы очевидно мстили за «несотрудничество» китайцев с ними в агрессии: КНР отказалась поддержать проект резолюции Совета безопасности, санкционировавшей вмешательство Запада в Косово.
Несмотря на начавшийся 10 мая вывод войск Югославии из Косово, государственный секретарь М. Олбрайт объявила, что Югославия должна выполнить все требования НАТО. Бомбежки усилились. В середине мая сообщали, что самолеты НАТО стали ниже опускаться, так как летчики были уверены в том, что они так разгромили систему ПВО Югославии, что и зенитки и ракеты им уже не угрожали.
В книге К.Г. Мяло сказано: «Авиация НАТО совершила 25 200 вылетов над территорией Югославии, сбросив 25 тысяч тонн взрывчатки… Самолеты НАТО использовали в Югославии начиненные слабо обогащенным ураном бомбы в восьми городах на юге Югославии… Бомбы с урановыми сердечниками сбрасывали в Косово, где образовался широкий пояс отравления местности… Хотя такое же оружие уже применялось во время войны в Заливе, в Косово масштабы его применения поистине впечатляют: 40 тысяч боеголовок с обедненным ураном!»
После достижения соглашения о прекращении огня 10 июня Билл Клинтон заявил, что это означает победу над Югославией. Президент США объявил, что Югославия не получит никакой помощи, пока Милошевич будет оставаться у власти.
Вслед за выводом югославских войск из Косово этот край покинули 350 тысяч сербов, опасавшихся за свои жизни. Оккупируя Косово, албанские националисты громили православные церкви и другие святыни, убивали сербов, оставшихся в своих домах. Вступившие в Косово войска НАТО не вмешивались в этноцид, осуществлявшийся наемниками США. В конечном счете, США и их союзники добились отторжения края Косово и Метохия от Сербии. В феврале 2008 года была провозглашена независимость республики Косово. США постарались признать новое государство, не учитывая, что это создает прецедент для аналогичных действий и в других странах мира, в том числе и союзной с Штатами Грузии.