Почему же Сталин отказался от независимого военно-морского Наркомата, который сам же учредил в декабре 1937 года? Разумеется, ни о каком капризе или старческом маразме, как пытаются представить это реформирование некоторые историки, речи не шло. Вспомним, что Наркомат ВМФ Сталин создавал с вполне определенными целями - он должен был стать руководящим органом будущего Большого флота, способного осуществлять самостоятельные операции в Мировом океане. Учитывая дату упразднения Наркомата ВМФ, Сталин, скорее всего, пришел к такому выводу еще во время войны, решив заниматься кардинальной административной перестройкой военного и военноморского аппарата сразу же после ее окончания. Что же послужило причиной данного реформирования? Во-первых, разумеется, опыт войны, которая продемонстрировала несоответствие второстепенного вклада ВМФ, на фоне явно раздутых штатов и правомочий отдельного Наркомата. Не случайно, практически на все время активных боевых действий Сталин, как мы уже знаем, просто лишил Наркома ВМФ права на руководство самыми воюющими флотами и вернул их только тогда, когда произошел полный перелом в войне, и наступавшая армия уже не слишком зависела от поддержки флота. Снижение статуса ВМФ в 1946 году объясняется и тем, что, понеся большие потери в Великой Отечественной войне (что касается послевоенного пополнения ВМФ за счет трофейных кораблей, то разношерстные, изношенные и большей свой частью устаревшие, боеспособности ВМФ СССР не прибавили), ВМФ уже объективно «не тянул» на отдельный Наркомат, ни по составу сил и численности личного состава, ни по способности решать самостоятельные оперативно-стратегические задачи в океанах, оставаясь, по-прежнему, прибрежным флотом. Наличие же избыточной государственной структуры, было совершенно нерационально. Упразднение же Наркомата существенно сокращало чиновничий аппарат, который к 1946 году в ВМФ был раздут непомерно. Напомним, что только что закончилась тяжелейшая война, и экономически-финансовое положение СССР было очень тяжелое. Кроме этого, независимость Наркома ВМФ и Главного Морского штаба от Генерального штаба являлось постоянным источником несогласованностей и нестыковок при планировании операций и организации взаимодействия, на фоне чего Сталину приходилось выслушивать постоянные жалобы сторон друг на друга. Что касается ближайших военных планов, то учитывая расклад сил, возможная война с недавними союзниками предполагалось, прежде всего, на европейском театре военных действий. То есть это снова должна была быть война континентальная, в которой ВМФ снова играл бы вспомогательную роль. Кроме этого, мы помним, что Наркомат ВМФ создавался под будущий океанский Большой флот, который так и не был создан. Для оставшихся в строю к 1945 году кораблей, такая громоздкая командная структура, как всесоюзный Наркомат, являлась так же излишней.
Можно с уверенностью сказать, что понижение статуса ВМФ, Сталин рассматривал исключительно как временную меру, предполагая вернуться к старой структуре, как только улучшится экономическая ситуация, а сам ВМФ наберет необходимую мощь.
Лишним доказательством тому, что Сталин, по-прежнему, рассматривал ВМФ как важный элемент обеспечения национальной безопасности, является то, что еще до окончания войны им были сформированы государственные комиссии по разработке перспективного плана военного кораблестроения, ориентированного на создание океанского, а не прибрежного флота. В дальнейшем все именно так и произошло - как только началось массовое поступление в состав флота новых кораблей, Сталин немедленно вернул ВМФ прежний самостоятельный статус. Совершенно не случайно деятельность обновленного руководства ВМС была направлена Сталиным, прежде всего, на восстановление и совершенствование береговой и судоремонтной инфраструктуры и совершенствование управленческой и организационной структуры флота. Именно туда направлялись выделяемые для ВМС деньги. Тем самым, закладывались основы для ожидаемого через несколько лет массового поступления новых кораблей.
Безусловно решение Сталина, по объединению двух военных наркоматов в одно министерство, на практике понизило статус Наркома ВМФ. Возьму на себя смелость предположить, что тот дождь наград, который И.В. Сталин обрушил на Н.Г. Кузнецова в конце войны (присвоение звание адмирала флота, последующее приравнивание звания адмирала флота к званию маршала Советского Союза, звание героя Советского Союза), являлись некой моральной компенсацией Наркому, за, уже задуманное Сталиным, послевоенное реформирование ВМФ.