Командир 8-го мехкорпуса генерал Д.И. Рябышев, комиссар корпуса Н.К. Попель в своих книгах вспоминали, как в первые дни войны к ним на КП в сопровождении полевого трибунала и комендантского взвода прибыл Вашугин. Схватив Рябышева за грудки, комиссар закричал: «За сколько продался, Иуда? Тебя, изменника, полевой суд слушать будет. Здесь, под сосной, выслушаем и у сосны расстреляем». Попытки Рябышева объяснить, что войска корпуса в соответствии с планом сосредоточиваются для атаки, ни к чему не привели. Вашугин потребовал тут же собрать все силы, что были под руками, и бросить вперед под командой комиссара корпуса Попеля. Попеля Вашугин напутствовал словами: «Не возьмете Дубно — расстреляем, возьмете — наградим!» В результате этого решения группа Попеля оказалась окруженной в Дубно и погибла.
Тот же Попель вспоминал, как Вашугин в хромовых сапогах и легком полушубке шел впереди цепей по льду залива на финские пулеметы в 1940 году. Это был храбрый, честный человек. Его ошибка состояла в том, что он не верил людям, понимал только силу угроз и расстрела, а в Великой Отечественной войне только такой подход был неприемлем. Поняв это, Н.Н. Вашугин нашел в себе мужество застрелиться.
Однажды на службе ко мне обратился по какому-то делу офицер и представился: «полковник Вашугин», это был внук Николая Николаевича Вашугина. И хотя мой дед был одним из танкистов генерала Рябышева, внуку комиссара Вашугина нет причины стыдиться своего деда, который честно работал и честно погиб.
Позднее Сталин понял, что Мехлис и Вашугин — не то, что необходимо в условиях войны. Поэтому Мехлис бы замещен на посту начальника ГЛАВПУРа Щербаковым, а комиссары, переименованные в замполитов, перестали вмешиваться в управление войсками. Для заключительного периода войны характерен случай, когда в 1-ю танковую армию в ходе сражения за Украину в 1943 году приехал Жуков. Узнав, что с одной из бригад, которой после ранения командира руководит замполит, потеряна связь, Маршал приказал: «Комиссарить вздумал? Судить трибуналом!» (по меньшей мере штрафбат. —
Ситуация коренным образом изменилась — политработники имели свой круг четко обозначенных задач. Еще 4 октября 1941 года Нарком обороны СССР Сталин подписал приказ № 391 о фактах подмены воспитательной работы в Красной Армии репрессиями. Этот приказ, в частности, гласил: