В тылу же правительства Комуча, на территории Сибири появилось Сибирское автономное правительство. Перед этим в Омске был создан Западно-Сибирский комиссариат, а затем – более консервативное Сибирское правительство. Власть этого правительства распространялась на всю территорию Сибири. В Екатеринбурге появилось своё Уральское правительство, но не имевшее вооруженных сил.
Чехи в свою очередь стремились к созданию центрального русского правительства, которое устранило бы необходимость их участия в борьбе.
Когда чехи начали борьбу с большевиками, то и не предполагали, что она будет столь затяжной. Первые успехи дались легко и вскружили голову чехословакам. В течение долгого периода чехи жили в комфортабельно оборудованных вагонах, покидая их только для кратковременных операций. Но поскольку война затягивалась, и приходилось прибегать к обороне, надо было часто ночевать в крестьянских избах, а то и вовсе под открытым небом. Все это быстро изменило настроение чехословацких войск и усилило давление их командования на Самару и Омск для ускорения образования единого правительства.
Результатом чехословацкой дипломатии и англо-французских союзников стала встреча двух правительств в Челябинске. На этой конференции Самара требовала подчинения Омска, и переговоры потерпели фиаско. Однако представители правительств решили собраться повторно. Новая конференция открылась в Челябинске в конце августа, но, увы, согласия не было достигнуто. Третья попытка переговоров планировалась на сентябрь и должна была пройти в Уфе. К тому времени золотой запас из Казани, составивший два эшелона, был передан под охрану чехов. Английский генерал Нокс и французский генерал Жанен, союзники Сибирского правительства, намеревались лично прибыть в Уфу и убедиться в наличии золота. А уж затем оказывать Белому движению военную и гуманитарную помощь.
Конец 1918 года. Сибирский диктатор
Сибирское правительство просуществовало недолго. В конце 1918 года в Омске был совершён переворот организацией «Белая Россия» в пользу адмирала Колчака, недавно вернувшегося из Америки. Офицеры хотели видеть во главе правительства Верховного правителя, сиречь – диктатора, человека умного и военного, сведущего в политике. И всем этим качествам соответствовал адмирал Колчак. Хотя изначально выдвигались и другие кандидатуры.
Пришедший к власти диктатор тотчас опубликовал своё обращение к населению Сибири, а затем и декларацию.