Геродот представляет Скифию в виде квадрата, каждая сторона которого равна 20 дням пути, или 4 тыс. стадий. Южная граница проходила по побережью Черного моря от устьев Истра до киммерийского Боспора, западная — по р. Истру, восточная — по р. Танаис. Северная граница определялась Геродотом по расселению нескифских племен между Танаисом и Петром (IV, 101). Через страну текут реки, из которых Геродот называет восемь наиболее значительных: Истр с левыми притоками — реками Парата, Арар, Напарис, Ордесс и Тиарант; Тирас, Гипанис, Борисфен, Пантикап, Гипакарис, Геррос и Танаис. На современной карте легко распределяются далеко не все реки. Достаточно твердое соответствие находят следующие из них: Истр — это Дунай, но из его левых притоков современным определенно соответствуют лишь Парата — Прут и, по всей вероятности, Тиарант — Сирот. По поводу остальных притоков существуют различные мнения. Однако большинство русских дореволюционных исследователей полагало, что Геродот имел в виду притоки, находившиеся к западу от Прута, современные реки Алуту или Олт, отождествляемую с Тиарантом, Сирет — с Араром, Яломицу — с Напарисом, Арджеш — с Ордессом (
Кроме восьми главных рек Скифии, Геродот называет еще Оар, Лик и Сиргис, впадающие в Меотиду — Азовское море. Б.А. Рыбаков предлагает отождествлять с ними небольшие современные речки — Корсак (Оар), Обиточную (Лик) и Чир — правый приток Дона (Сиргис), отличающийся большими размерами.
Из достопримечательностей Скифии Геродот упоминает горький источник — Эксампей, впадающий в Гипанис на расстоянии четырех дней плавания по нему до моря (IV, 52), настолько горький, что, несмотря на свою незначительную величину, он изменяет вкус воды в Гипанисе, с которым немногие реки могут сравниться по величине. Из многочисленных гипотез наиболее вероятной мне представляется та, которую недавно выдвинул К.К. Шилик (1979, с. 455), отождествивший Эксампей с р. Гнилой Еланец. Б.А. Рыбаков (1979, с. 37) видит в Эксампее также близко расположенную к устью р. Синюха небольшую речку Черный Ташлык, впадающую в Синюху со стороны Борисфена в 10–12 км от современного г. Первомайска.
Кроме рек, Геродот называет несколько раз большое лесное урочище Гилею (IV, 9, 18, 55, 76). До недавнего времени все исследователи единодушно считали, что речь идет о лесном массиве-плавнях на нижнем Днепре и в Олешковских песках. Б.А. Рыбаков предполагает, однако, что под термином Гилея Геродот имеет в виду не название определенного места, а нарицательное имя, обозначающее лес, рощу. В связи с этим, по мнению ученого, у Геродота идет речь о двух гилеях: одна находилась в низовьях Днепра и примыкала к Ахиллову Бегу, другая — при впадении Ворсклы в Днепр, т. е. в среднем Поднепровье. А.А. Нейхарт отметила, что анализ текста Геродота не дает оснований для категорического вывода о существовании двух Гилей (1982, с. 160).