Самым известным храмом является Хагар-Ким на южном берегу Мальты. Он имеет любопытную форму и похож на поперечное сечение черепа, а датируется IV тысячелетием до н. э. Он сложен из массивных камней весом до 30 тонн. Считается, что статуи и статуэтки в этом и других мальтийских храмах служили для поклонения некой богине. Это поклонение отражено и в архитектуре искривленных полукруглых и эллиптических помещений, которые в некоторых храмах, вроде Гантии на Гоцо, были соединены в форме трилистника.
Строительство храмов неожиданно прекратилось около 3000 года до н. э., и с островов исчезло все население, а вновь они были заселены лишь 500 лет спустя. Ария Гимбутас в своей книге «Цивилизация Богини» пишет:
Археолог Джозеф Эллал выдвинул собственную версию о том, почему люди покинули Мальту. В книге «Допотопная культура Мальты» он выстраивает историю знаменитых храмовых построек вплоть до их разрушения около пяти тысячелетий назад. Изучая храмовое сооружение Хагар-Ким, археологи обнаружили, что несколько огромных каменных блоков храма было опрокинуто, как если бы некая чудовищная сила ударила их с запада. Эллал пишет также:
Джозеф Эллал убежден, что нынешний Гибралтарский пролив первоначально был заблокирован от Атлантического океана. В какой-то момент около 3000 года до н. э. вода взломала этот барьер, и по всему Средиземному морю прокатилась огромная приливная волна. Она затопила храмы Мальты и оставила на поверхности всего острова метровый слой ила и песка. В той же книге автор упоминает город Ксари-Сусте в Месопотамии, который был похоронен под трехметровым слоем песка и в котором во время раскопок под песком были обна ружены накрытые к обеду столы и скелеты спящих людей. Все это подсказывает, что катастрофа произошла неожиданно.
Новые данные об этом катаклизме, отраженном так же в шумерских мифах и легендах, были найдены в 1929 году, когда сэр Леонард Вулли начал раскопки Ура близ города Ан-Насирии в современном Ираке. В «Энциклопедии мировой мифологии» говорится:
Новые данные призваны показать, что это наводнение было настолько широкомасштабным, что затопило практически всю Нижнюю Месопотамию и погубило всех ее обитателей.
Уровни моря во Франции