Петроградский совет требовал заключить семью Романовых в Петропавловскую крепость. С этим и был связан их поспешный отъезд, организованный Керенским. Британское правительство рассуждало, должен ли король Георг пригласить оставшихся бездомными родственников к себе и как это повлияет на отношения с новоиспеченной республикой. Министр иностранных дел Временного правительства лидер кадетов Павел Милюков торопил англичан: «Это последняя возможность обеспечить свободу этим несчастным и, возможно, спасти их жизнь». Британцы увиливали, предлагали вывезти царскую семью в Швейцарию или в Данию. В конце концов они все же официально предложили царской семье убежище, но позже премьер-министр «переубедил» короля Георга, опасавшегося недовольства английского общества. Тогда Керенский решил, что лучшим убежищем для царской семьи станет Тобольск. Позже он писал: «Некоторые монархисты утверждают, что единственной причиной такого выбора было наше желание отплатить царю той же монетой — сослать его в Сибирь, куда некогда ссылали революционеров. Но до Тобольска можно было добраться северным путем, не пересекая плотно населенные регионы. Что же касается места, то можно было бы обойтись без хлопотных приготовлений к путешествию в Тобольск: под рукой находилась Петропавловская крепость, а еще лучше — Кронштадт. Я остановился на Тобольске по следующим причинам. Отдельность Тобольска и его особое географическое положение, немногочисленный гарнизон, отсутствие промышленного пролетариата, состоятельные, если не сказать старомодные жители. Кроме того, там превосходный климат и удобный губернаторский дом, в котором царская семья могла бы жить с некоторым комфортом».
Императорская семья ехала в поезде японской миссии Красного Креста. (В новой войне Япония стала союзником России.) Их сопровождали камердинеры, лакеи, повара, фрейлина Александры Федоровны, писцы, секретарь и другая прислуга, а также Пьер Жильяр и доктор Евгений Сергеевич Боткин с сыном и дочерью. Охраняли поезд более трехсот солдат. В Тюмени все пересели на пароход. На новое место жительства прибыли через неделю. Поселились в доме губернатора. Вокруг дома спешно возвели забор. Узников охраняли солдаты. Дом был старым, обветшавшим, зимой температура в комнатах не поднималась выше 10 градусов. Императрица писала в Петербург Анне Вырубовой: «Погода переменчивая: мороз и солнце, потом тает и темно. Ужасно скучно для тех, кто любит длинные прогулки и кто их лишен. Уроки продолжаются, как раньше. Мать и дочки работают и много вяжут, приготовляя рождественские подарки. Как время летит, скоро будет 9 месяцев, что я с многими простилась… и ты одна в страдании и одиночестве. Но ты знаешь, где искать успокоение и силу, и Бог тебя никогда не оставит — Его любовь выше всего. Все, в общем, здоровы, исключая мелкие простуды, иногда колено и ручка пухнут, но, слава Богу, без особых страданий. Сердце болело последнее время. Читаю много, живу в прошлом, которое так полно богатых и дорогих воспоминаний. Надеюсь на лучшее будущее. Бог не оставляет тех, кто Его любит и верит в Его безграничное милосердие, и когда мы меньше всего ожидаем, Он нам поможет и спасет эту несчастную страну. Терпенье, вера и правда».
Для развлечения дети начали ставить короткие пьесы: чеховского «Медведя», английские фарсы. Мария писала подруге — Зинаиде Толстой: «Мы живем тихо, гуляем по-прежнему два раза в день. Погода стоит хорошая, эти дни был довольно сильный мороз. А у Вас, наверное, еще теплая погода? Завидую, что Вы видите чудное море! Сегодня в 8 часов утра мы ходили к обедне. Так всегда радуемся, когда нас пускают в церковь, конечно, эту церковь сравнивать нельзя с нашим собором, но все-таки лучше, чем в комнате. Сейчас все сидим у себя в комнате. Сестры тоже пишут, собаки бегают и просятся на колени. Часто вспоминаю Царское Село и веселые концерты в лазарете; помните, как было забавно, когда раненые плясали; также вспоминаем прогулки в Павловск и Ваш маленький экипаж, утренние проезды мимо Вашего дома. Как все это кажется давно было. Правда? Ну, мне пора кончать. Всего хорошего желаю Вам и крепко Вас и Далю целую. Всем Вашим сердечный привет».
В декабре отпраздновали Рождество. Пьер Жильяр вспоминал: «Императрица и великие княжны в течение долгого времени готовили по подарку для каждого из нас и для прислуги. Ее Величество раздала несколько шерстяных жилетов, которые сама связала; она старалась таким образом выразить трогательным вниманием свою благодарность тем, кто остался им верен. 24 декабря священник пришел служить Всенощную на дом; все собрались затем в большой зале, и детям доставило большую радость преподнести предназначенные нам «сюрпризы». Мы чувствовали, что представляем из себя одну большую семью, все старались забыть переживаемые горести и заботы, чтобы иметь возможность без задних мыслей, в полном сердечном общении наслаждаться этими минутам спокойствия и духовной близости».