В начале 1918 г. Академию эвакуировали в Екатеринбург, затем в Казань. В июле 1918 г. основная масса преподавателей и учащихся отказалась выступить против наступавших на Казань частей Чехословацкого корпуса и Русской армии и перешла на их сторону. В связи с этим 4 августа 1918 г. приказом Реввоенсовета республики Академию формально расформировали. Но она продолжила свою работу в рядах Белого движения сначала в Екатеринбурге, затем в Томске и Омске. В конце 1919 г. эвакуирована во Владивосток, где в казармах 3-го Сибирского стрелкового полка на острове Русском в конце 1921 г. состоялся последний выпуск ее слушателей.
В 1927 г. в Париже бывшим профессором Академии Н.Н. Головиным открыты Зарубежные высшие военно-научные курсы, которые виделись их основателю и руководству Российского общевойскового союза как преемник Академии Генерального штаба. Отделения Курсов были открыты в ряде других европейских центров Белой эмиграции. Курсы прекратили свое существование только после начала Второй мировой войны.
В 1923 г. в зданиях бывшей Николаевской академии Генерального штаба – Императорской Николаевской военной академии, разместили Высшую военную электротехническую школу командного состава РККА, созданную приказом Реввоенсовета Республики № 1872 от 8 ноября 1919 г.
Предыстория этого высшего военного учебного заведения, готовящего высококвалифицированные командные и инженерные кадры для войск связи Вооруженных сил и других силовых ведомств РФ, относится к середине XIX столетия, когда в Петербурге в 1857 г. организовали Военно-техническое гальваническое заведение, состоявшее из офицерского класса и гальванической учебной роты и находившееся в распоряжении штаба генерал-инспектора по инженерной части. В заведении проводилась подготовка военных специалистов-электриков для телеграфных частей и других электротехнических подразделений. В 1894 г. гальваническое заведение преобразовано в Военную электротехническую школу, которая находилась в доме № 6 на Инженерной улице (начальники – генерал-майор В.А. Романов, до 1907 г.; полковник Г.В. Бурман в 1908–1911 гг. –
В июне 1921 г. Высшая военная электротехническая школа комсостава РККА реорганизуется в Военную электротехническую академию РККА и Флотов.
В апреле 1925 г. вышло Постановление Совета Народных Комиссаров СССР об объединении артиллерийской, военно-инженерной и электротехнической академии и создании Военно-технической академии для подготовки командного состава с высшим военно-техническим образованием. Ей было присвоено имя Ф.Э. Дзержинского.
21 мая 1932 г. Комиссия обороны при СНК СССР приняла постановление о развертывании ряда новых специальных военных академий РККА, среди которых была «Военная электротехническая академия». Академия развертывалась в составе шести факультетов: командного, радиотехнического, проводной связи, энергетического, электромеханического и промышленного. Кроме того, в ее штат входили «Курсы усовершенствования высшего начальствующего состава связи» (КУВНАС). Позднее, в 1933 г., организован «Вечерний факультет связи». 1 апреля 1933 г. Академия перешла в подчинение начальника связи Красной армии.
В связи с 50-летием героя Гражданской войны, члена Реввоенсовета СССР Семена Михайловича Буденного Приказом РВС СССР от 25 апреля 1933 г. Академии присвоено его имя. Она стала именоваться: «Военная электротехническая академия имени С.М. Буденного», а 7 мая 1932 г. на окраине Ленинграда, на проспекте Бенуа (ныне – Тихорецкий пр.) состоялась торжественная закладка городка для академии. Строительство его в основном закончили в 1936 г. Электротехническая академия покинула стены бывшей академии Генерального штаба на Суворовском проспекте. Казалось, навсегда…
Прошли многие годы, и в 1975 г. здание на Суворовском проспекте передали передислоцированному в Ленинград Горьковскому высшему военному командному училищу связи, преобразованному сначала в Ленинградское высшее военное инженерное училище связи, а в ноябре 1998 г. – в 4-й (командный) факультет Санкт-Петербургского Военного университета связи, с июля 2004 г. – Военной академии связи им. С.М. Буденного. Круг замкнулся – хозяином старинного здания вновь стала Военная академия связи им. С.М. Буденного.