1 июля 1919 года Гайда оставил Пермь и Кунгур. Положение все более осложнялось, и некоторые осторожные люди, вроде министра барона Алексея Павловича Будберга, рекомендовали Колчаку подумать о том, чтобы перевезти правительство в Иркутск, а войска отвести за Ишим, дать там им устроиться и отдохнуть, перейдя временно к обороне.
«Адмирал согласился, но другие поймали его на его коньке и указали, что отъезд будет истолкован так, что будто адмирал боится опасности, и что, кроме того, переезд произведет дурное впечатление за границей»
[86]. Колчак отложил переезд. Более того, по настоянию Дмитрия Лебедева, дал согласие на подготовку нового наступления под Челябинском, для восстановления боевого духа войск, упавшего после недавних неудач. План Лебедева и его штаба состоял в том, чтобы заманить 5-ю армию Тухачевского в Челябинск. С северной части города начинали наступление части генерала Войцеховского силами до 16 тыс. человек, перерезая железную дорогу Челябинск — Екатеринбург, а с южной стороны города армию Тухачевского атаковали части генерала Каппеля, силами до 10 тысяч штыков, перехватывая железнодорожное направление Челябинск — Златоуст. Во фронт большевистской армии должна была ударить группа генерал-майора Владимира Дмитриевича Косьмина. В силу собственно оперативно-тактической неподготовленности и надежды на случай — панику в стане большевиков при виде стремительно приближающихся белых частей, — Лебедев недооценил противника, который не начал отступление под угрозой окружения, имея в руках ресурсы большого города. Севернее Челябинска начала наступление 3-я советская армия, развернутая во фланг частям Войцеховского, вынужденного обороняться. Из резерва Восточного фронта его командующий Фрунзе отправил в тылы белых целую дивизию. Потери с двух сторон были ужасающие, однако большевистское командование с легкостью восполняло их за счет поголовной мобилизации местного населения, а ресурсы колчаковцев находились почти на исходе. В результате белое командование было вынуждено снять сразу три дивизии, находившихся на переформировании, и бросить их в бой под Челябинском. Генерал-лейтенантом Михаилом Константиновичем Дитерихсом были брошены в бой последние резервы колчаковской армии — две сибирские дивизии, только что сформированные за счет мобилизованных и добровольцев и даже не прошедшие базовых стрелковых курсов. Бои с большевиками продолжались неделю, и наступивший в их ходе перелом оказался не в пользу белых. Только пленными колчаковцы потеряли 15 тысяч человек.Нужно ли говорить, что наступление 28–30 июля 1919 года, обернулось разгромом уже уставших частей свежими и прекрасно организованными большевистскими частями. Лебедев пытался оправдать это бессмысленное с военной точки зрения наступление неподготовленностью новобранцев, плохой работой Омского округа с комплектацией военными кадрами, однако следом за неудачами на фронте последовали восстания в тылу, подготовленные большевистским подпольем. Колчак приблизился к пониманию, что нужно решать вопрос с начальником штаба и к 10 августа 1919 года наконец решил расстаться с Лебедевым.
Окончательно надорвавшие свои силы, потеряв боеспособность и стратегическую инициативу, белые армии оставляли Урал и откатывались в Сибирь. Дальнейшее существование власти Колчака определялось уже не успехом фронтовых операций, а сибирскими дистанциями.