Изучение генома показало, что коронавирус 2002–2003 гг. в достаточной степени отличалось от любого из известных коронавирусов человека или животных.
Во время вспышки 2002–2003 годов инфекция SARS была зарегистрирована в 29 странах Северной Америки, Южной Америки, Европы и Азии. В общей сложности было выявлено более 8 тыс. инфицированных людей с большим числом смертельных исходов, связанных с развитием тяжелого острого респираторного синдрома. Смертность составляла при этом почти 10%.
Анализ последовательности вируса, показал, что этот вирус содержал 29-нуклеотидную последовательность, необнаруженную ранее у большинства коронавирусов человека. В частности тех, которые были вовлечены во всемирное распространение предыдущих эпидемии.
В вирусах животных эта нуклеотидная последовательность сохраняет целостность. И не мутирует с такой скоростью. Тогда было неясно, сыграла ли эта хромосомная перестройка нуклеотидной последовательности роль в способности нового штамма распространяться между людьми или вирулентностью вируса.
Любопытно, что данные исследований, проведенных среди работников продовольственного рынка в районах, где, вероятно, началась эпидемия тяжелых пневмонии в 2002–2003 гг., показали, что 40% торговцев дикими животными и 20% людей, работа которых связана с забоем животных, были серопозитивны в отношении коронавируса. Хотя ни у одного из них не было симптомов. Все они имели антитела, указывающие на контакт с инфекцией.
Эти данные свидетельствуют о том, что эти люди подверглись воздействию вируса, который часто вызывал бессимптомную инфекцию. Бессимптомная инфекция, бессимптомные носители вируса – будет важной составляющей уже новой пандемии. Это то, что приведет в дальнейшем к невозможности контролировать распространение нового вируса, возникшего в 2019.
Политика инфекционного контроля способствовала прекращению эпидемии атипичной пневмонии, тогда в далеком 2003 году. Последняя серия документированных случаев на сегодняшний день была выявлена в апреле 2004 года.
Эпидемия атипичной пневмонии дала миру большой вклад в изучении этой группы вирусов. Расширила изучение не только в области ветеринарной вирусологии, но и у человека.
Что же происходит сейчас? Ученые активно изучают коронавирусный геном и его структуру. Коронавирусы – это вирусы среднего размера, с длиной нуклеиновой кислоты около 30 кб. РНК является самой крупной из известных вирусных РНК.
Мутации распространены в природе. Кроме того, коронавирусы способны к генетической рекомбинации, если два вируса заражают одну и ту же клетку одновременно. Соответственно становиться понятным заявление Люка Монтанье, о том в геноме COVID-19 находятся гены ВИЧ и малярийного плазмодия. Правда, согласно этим заявлениям в слишком малом количестве для природной мутации. Остается неясным, действительно ли 1% генетической информации вируса ВИЧ мог попасть в коронавирус путем природной эволюции?