Кабинет освещался массивными бронзовыми люстрами, изготовленными в древнерусском стиле. Непосредственно за кабинетом размещались личные апартаменты великого князя – его парадная спальня с большим арочным окном, выходящим в сад. В спальне находились кровать огромных размеров, киот-«образница», дубовый комод в стиле Людовика XV, большой мраморный умывальник и венецианское зеркало. У окна при жизни Алексея Александровича всегда располагался стол для чтения и старинное бюро. К спальне примыкала княжеская гардеробная, по стенам которой впритык друг к другу установили двадцать четыре высоких дубовых стенных шкафа.
В этой части дворца находились две лестницы: одна – служебная, а вторая – винтовая, в башне с бельведером. Служебная узкая лестница вела из цокольного этажа на второй этаж центрального корпуса, к комнатам дежурных адъютантов генерал-адмирала, в библиотеку князя, к ружейной комнате – помещениям, не имевшим какой-либо художественной отделки.
Помещение княжеской дворцовой библиотеки было оборудовано с трех сторон большими арочными окнами, выходящими в парадный двор. Из библиотеки можно было пройти на широкую террасу, с площадки которой открывался замечательный вид на набережную реки Мойки, комплекс Новой Голландии, Адмиралтейские верфи и полноводную Неву. Библиотеку оборудовали вместительными встроенными книжными шкафами, круглым большим столом и удобными стульями. Помещение библиотеки небольшим коридором соединялось с комнатой дежурного адъютанта, исполнявшего обязанности секретаря генерал-адмирала. Здесь же существовала так называемая «запасная» комната Алексея Александровича, в которой хранилась уникальная коллекция старинного оружия всех времен и стран. Вместе с оружием в «запасной» комнате хранились военные мундиры русских императоров – Николая I, Александра II и Александра III.
Все эти помещения соединялись с чердачным отсеком дворца, ставшим хранилищем уникальных восточных ковров, старинной мебели и одежды из многих стран Азии, в которых бывал князь. Винтовая лестница из 120 ступеней белого эст-ляндского мрамора, смонтированная в высокой башне дворца великого князя, поражала всех своими утонченными ренессансными совершенными линиями. Очертания ее невероятного изгиба подчеркивались гигантской, в треть круга, конической консолью, завершенной женской беломраморной головкой. Невероятно тонкая вязь лестничной кованой решетки естественно сочеталась с тонкими завитками растительного орнамента и со вставленными на мраморных площадках великокняжескими монограммами «А.А.» под золоченой короной. Полагали, что с верхней площадки башни просматривается не только Финский залив, но и Кронштадт. Беломраморная лестница вела в Собственный кабинет владельца двора, обустроенного выше всех дворцовых покоев и напоминавшего командирскую рубку военного корабля. Стены кабинета, обитые плотной тканью, натянутой на резные дубовые рамы, прорезали арочные итальянские окна, которые прекрасно освещали помещение в дневное время и обеспечивали панорамное обозрение города. Вечером этот кабинет освещался электрическими бронзовыми бра. В его помещении располагался прекрасный камин, украшенный ярким майоликовым панно с морским сюжетом. Верхний Собственный кабинет великого князя занимали большой письменный стол, кресла, диван и шкаф. Рядом с Кабинетом находилась верхняя интимная спальня Алексея Александровича.
В бельэтаже к лестнице примыкала ванная с глубоким мраморным бассейном и «шкафная уборная», или туалетная, с панелями и шкафами из полированного красного дерева. Из вестибюля собственного подъезда с мраморным камином по мраморной лестнице можно было пройти в три парадные гостиные дворца: Английскую, Китайскую и Фламандскую. Английская гостиная считалась самым большим помещением дворца. Ее оформили в стиле ренессанс и декорировали темным деревом до уровня подоконников, а выше ее стены затянули огромными штофными шпалерами. В углу помещения установили двухъярусный камин во всю высоту зала, сложенный из резного, в рустах, серого камня, с дубовой резной отделкой. Стенные дубовые панели английской гостиной имели карниз, являвшийся своеобразной полкой для княжеской коллекции старинной британской оловянной посуды.
Китайская гостиная была сооружена по настоянию великого князя, посещавшего в молодые годы Японию и Китай. Ее стены Месмахер облицевал лакированным палисандровым деревом и восточным национальным декоративным шелком с изображением драконов и древних иероглифов и рисунками, воспроизводившими знаменитого китайского льва «Ши-Цзы». Убранство гостиной дополняли предметы китайского прикладного искусства – ширмы, расписанные по эскизам автора проекта М.Е. Месмахера, со стилевыми китайскими пагодами, драконами, иероглифами. Росписи оказались настолько колоритными и яркими, что прекрасно контрастировали с темным мореным дубом и красным деревом мебели гостиной. Многочисленные китайские безделушки и цветные бумажные фонари придали естественный национальный колорит этой дворцовой гостиной.