Последние годы жизни Сен-Мартен потратил на изучение Якоба Бёме, «тевтонского богослова», чьи идеи оказали влияние на таких людей, как Уильям Блейк и Гегель. Живший в семнадцатом столетии Бёме, по профессии сапожник, испытал мистические ощущения, глядя на солнечный свет, отраженный оловянной тарелкой. Он заявил, что видит «сущность» вещей, и написал увесистые тома на таинственном алхимическом языке. Угрюмо и основательно работал Сен-Мартен, пытаясь соединить видения Бёма со своими ранними мартинистскими доктринами. Казалось, он чувствовал приближение своих последних дней. Продолжая до самого конца писать свои сочинения, он умер от апоплексического удара 13 октября 1803 года. Последователи его идей стали называть себя также мартинистами, что вызывает некоторую путаницу в истории оккультизма.
Основная идея Сен-Мартена заключается в том, что миссия человечества состоит в «починке» мира. Похожая доктрина существует в Каббале, где создание является результатом избытка сефирот Древа Жизни. Наша работа — как-нибудь устранить беспорядок. Вальтер Бенджамин, неортодоксальный каббалист с марксистским уклоном, видел в истории человечества нескончаемую череду случайных событий, похожую на беспрерывный ряд аварий на некой извечной автостраде.
С этим Сен-Мартен согласился бы, но не разделил бы веру Бенджамина в марксистскую идеологию: сам он полагался на нашу способность находить контакт с первоисточником. Толстой, Август Стриндберг и О.В. Милош читали работы Сен-Мартена. А.Е. Уэйт даёт, вероятно, наиболее удачное описание Неизвестного Философа:
«Неизвестный Философ… имел много друзей, он был человеком стойких привязанностей… Сен-Мартен — практически единственный мистик, который одновременно являлся политиком с собственной программой реконструкции общества, музыкантом и поэтом, ценителем красивых женщин, критиком своих современников, обозревателем своего времени. Он был врачом душ в полном смысле слова, и в этой своей роли постоянно держал руку на пульсе времени».
Карл фон Экартхаузен