Их третий курс был ознаменован побегом Сириуса Блэка, который, по имеющейся информации Гермионы, хотел смерти Поттера. Она со злорадством ждала, когда же Блэк прикончит виновника того, что его Хозяин погиб и исчез. Но все закончилось по-другому.
Весь год Школу охраняли Дементоры, которых прислало Министерство. Весь год Школа была подвержена тому же влиянию, что и Азкабан. Гермиона поняла, как же жестоко магическое правосудие к своим преступникам. Ходили слухи, что Блэк несколько раз проникал в Хогвартс, даже один раз в Башню Гриффиндора, что казалось странным, ведь Поттер учился на Равенкло.
Но конец года расставил все точки над «И». Рядом с Запретным лесом были найдены тела профессора Снейпа и некоего Питера Петтигрю, который считался погибшим, а Сириуса Блэка задержал Ремус Люпин в Хогсмите и дожидался Авроров. После допроса с применением «Сыворотки Правды», в суд над Блэком вмешался Поттер, было обнародовано, что Петтигрю был истинным предателем семьи Поттер, за что и был казнен ранее, правда случайно.
После этого, Блэк судился с Дамблдором и Министерством, и выиграл суд - Гарри Поттер перешел под его опеку. Дамблдор был омрачен результатом проигранного суда. И Гермиона его понимала, Блэки были очень известными Темными Магами.
Их четвертый курс был связан с Турниром 3-х Волшебников, в котором участвовала четыре Чемпиона. Никто не знал, как Поттер смог вмешаться в работу древнего артефакта, но он стал одним из них. Он наравне со старшими студентами трех Школ участвовал в страшнейших испытаниях. Битва с Драконом за золотое яйцо, Поттер использовал неизвестные никому заклинания и убил Венгерскую Хвосторогу. Правда, он и сам пострадал, но всё же убил могучее создание.
Перед Рождеством произошло кое-что странное, Поттер впервые заговорил с Гермионой первым. И она была удивлена, что он приглашал её на Святочный Бал. Но Гермиона резко отказала и ушла из библиотеки. После она была приглашена Виктором Крамом, который весь год пытался за ней ухаживать. Но Гермиона была заинтересована лишь в знаниях, а не в отношениях, чем и оттолкнула от себя знаменитого ловца. Хоть она и стала его «сокровищем» во втором испытании. «Сокровищем» же Поттера стала третьекурсница Равенкло, с которой он был на Балу – Луна Лавгуд. Она часто слышала, будто над этой третьекурсницей издевались на собственном факультете, но у неё не было доказательств, что в этом был замешан Поттер. Третье Испытание стало для всех шоком, Поттер просто прорвался сквозь стены лабиринта к Кубку, а через час вернулся весь израненный и с небольшой улыбкой, как у маньяков из ужастиков. После Турнира начали ходить слухи, что «Темный Лорд Волдеморт» воскрес, и многие считали, будто в этом замешан Поттер. Также они узнали, что Крауч-старший и его, якобы погибший в Азкабане, сын Барти-младший были Пожирателями Смерти и были найдены мертвыми на старом кладбище, а Аластор Муди был найден в собственном сундуке.
Пятый курс еще даже не начался, а в «Пророке» была статья о том, как маггловского кузена Поттера поцеловал Дементор и о его суде. Гермиона едва не кричала от радости, когда думала о свершение правосудия. Но в статье было сказано, что Поттера в то время даже не было в стране. Он, Сириус Блэк и их друзья отдыхали в Австрии, где конкретно не сказано. Более о суде не написали, но как во время поездки узнала Гермиона, от Лаванды, которая пообщалась со Сьюзан Боунс, все документы и события суда были засекречены. А ДМПО начало аресты и допросы среди «чистокровных», которые ранее были обвинены в содействии Пожирателям Смерти. Среди них был и Люциус Малфой.
В Хогвартс приехала Долорес Амбридж, которая заняла должность профессора ЗоТИ, но не вела предмет, как подобает преподавателю. Её «учебник был необходим лишь тем, кто еще не учится в Хогвартсе или же первокурсникам», вот что заявил Поттер на первом занятие. Амбридж назначила ему отработку в своем кабинете. А через несколько дней мадам Амбридж была арестована за «причинение телесных повреждений» наследнику Рода Поттер и «применение Непростительного Проклятия», а Поттер ходил с повязкой на руке несколько дней. Далее в Замок приехал Сириус Блэк, который и вел их предмет в тот год.
В конце пятого курса, Гермиона узнала, что Волдеморт действительно воскрес и даже сразился с Поттером в Министерстве, где и погиб. Многие считали, что Волдеморт просто решил передать бразды правления Тьмой Британии в руки Поттера и сам шагнул в Арку Смерти, но Беллатрикс Лестрейндж это отрицала. Она была найдена связанной в «Комнате Смерти» и со слезами на глазах кричала на полумертвого Поттера, обвиняя его в смерти Темного Лорда. После этого дня, все Пожиратели Смерти были казнены – их отправили в Арку Смерти, вслед за их Хозяином. Лишь Беллатрикс была казнена через поцелуй Дементора, из-за того, что она убила Сириуса Блэка.