Длинный, почти 200-метровый корпус набирался по продольной схеме, с использованием стали ST-52 для основных частей конструкции и включением броневых листов в качестве элементов прочности. Килевая балка высотой около 1,5 м состояла из четырех толстых листов, дополнительно подкрепленных через каждые пол-шпации. Крейсер имел двойное дно, разделенное семью продольными переборками (стрингерами), пронумерованными от I у киля до VII у верхней кромки пояса. (Двойное дно фактически переходило в конструкцию двойного борта, прикрывавшую снаружи броневой пояс по всей его высоте). Они через одну выполнялись водонепроницаемыми, причем переборка IV продолжалась дальше вверх, переходя в ПТП (противоторпедную переборку) из высокоэластичной броневой стали толщиной 20 мм Для обеспечения достаточной прочности килевой структуры при постановке корабля в док, пространство между килем и ближайшей к нему продольной переборкой двойного дна (I) представляло собой "сетку" из продольных и поперечных связей. Продольная прочность увеличивалась за счет 32 дополнительных стрингеров, располагавшихся между продольными переборками и приваренных к шпангоутам. Структура двойного дна и двойного борта простиралась примерно на 72% длины крейсера. Количество отверстий в борту было сведено к минимуму. В целом вся конструкция корпуса выглядела весьма внушительной, хотя, как и на большинстве немецких кораблей, несколько перетяжеленной.
Нельзя сказать, что конструкторы вообще не пытались сэкономить вес корпуса. Наружная обшивка крепилась исключительно за счет сварных соединений, кроме тех зон, где ее роль играли броневые листы, которые приклепывались к остальным частям обшивки при помощи накладок. По преимуществу сварными были и 29 водонепроницаемых поперечных переборок, которые делили крейсер на 14 полностью изолированных отсеков. Большинство поперечных переборок доходило до верхней палубы. В соответствии с германской практикой главные отсеки нумеровались с кормы до носа римскими цифрами от I до XIV.
В отсеках двух самых нижних палуб - палуб трюма и двойного дна - в основном располагались нефтяные цистерны и емкости для смазочных материалов, а также помещения гирокомпаса и поста живучести. Следующая вверх палуба, нижняя платформа, служила для размещения жизненно важных объектов крейсера: снарядных погребов главного калибра (отсеки II и X), турбин (отсеки III и V), котлов (отсеки VI, VII и VIII), а также противопожарного оборудования, центр управления которым находился в специально выделенном отсеке X. Верхнюю платформу, имевшуюся только между шпангоутами 10 и 47 в корме (отсеки I и II) и между шпангоутами 130 и 167,5 в носу (отсеки IX и XI), почти полностью занимали зарядные погреба главного калибра. В носовых отсеках помещались также нижний центральный пост, радиорубка и электрощитовые. В отсеке VII находилось устройство, отличавшее германские тяжелые крейсера от всех остальных кораблей этого класса. Речь идет о пассивной системе стабилизации качки по типу цистерн Фрама. В двух цистернах, по одной с каждого борта, соединявшихся широкой трубой на уровне палубы трюма, имелось около 200 т жидкости (обычно воды), переливанием которой управляла специальная гиросистема. Такие стабилизаторы устанавливались на ряде немецких кораблей, но сведения относительно их боевой ценности отсутствуют.
На следующей, броневой палубе, располагались практически все помещения для матросов, в том числе кубрики и столовые. Их площадь сильно ограничивалась дымоходами и барбетами ГК. Единственным "нежилым" помещением на этой палубе (официально - палубе твиндека) являлась запасная радиорубка. По стандартам других стран, особенно американским, помещения для команды на "хипперах" были слишком тесными и неудобными. Постоянное нахождение на кораблях сверх-комплектного персонала приводило к тому, что он был вынужден размещаться на боевых постах и во время отдыха.
В нижней надстройке, простиравшейся от 1-го до 4-го барбета, львиная доля пространства приходилась на все те же дымоходы, а также ангары и вспомогательные помещения для авиаоборудования. Оставались две зоны: спереди, где находился медицинский блок, и сзади, где шли каюты командного состава. Еще далее в корму, сразу за барбетом кормовой возвышенной башни, помещалась кают-кампания, где одновременно могли обедать 60 офицеров. Медчасть крейсера имела хорошее оборудование и включала специальные помещения для операционной и рентгеновского кабинета.
Второй уровень надстройки в корме целиком выделялся "святая святых" - блоку помещений командира корабля. Там имелись кабинет, спальня и ванная; практически полностью идентичные адмиральским помещениям, расположенным в той же надстройке по правому борту. Только в адмиральский блок входила еще и большая приемная, использовавшаяся в качестве зала для важных совещаний. Аналогичный уровень носовой надстройки использовался для кают командного состава.