Была введена новая система обогрева машины, по типу устанавливавшегося на «пантерах» Ausf.G, — над левым вентилятором на крыше моторного отделения смонтировали специальный короб, отводящий поток тёплого воздуха от двигателя в боевое отделение.
Однако и в 1945 году выпускались «ягдпантеры» с крышей моторного отделения по типу танка «Пантера» Ausf.А, видимо, из имевшихся заделов.
Для того чтобы более удобно разместить радиоаппаратуру, изменили расположенную впереди справа укладку снарядов. Теперь боекомплект «Ягдпантеры» составлял 58 снарядов вместо 60.
Первым подразделением, получившим на вооружение «ягдпантеры», стал 654-й батальон тяжёлых истребителей танков (schwere Panzerjägerabteilung), до этого оснащённый «фердинандами». Ещё в августе 1943 года, после боёв на Курской дуге, это подразделение передало оставшиеся в строю «Фердинанды» однотипному по организации 653-му батальону и убыло в Германию. Но из-за задержек с выпуском «ягдпантер» подготовку экипажей для новых самоходок начали только в начале 1944 года. Причём 654-й батальон первоначально использовал в качестве учебных машин восемь эвакуационных танков «Бергепантера», полученных в феврале 1944 года.
Только 23 марта 1944 года Управление вооружений сухопутных войск дало разрешение на эксплуатацию двух «ягдпантер», которые поступили в школу истребителей танков в Миелау. Эти машины в дальнейшем использовались в качестве учебных.
28 апреля 1944 года Управление снабжения сухопутных войск направило первые восемь истребителей танков «Ягдпантера» 654-му батальону тяжёлых истребителей танков. По штатам K.St.N. 1149 с и К.St.N. 1154 а он должен был состоять из трёх рот, каждая из которых включала три взвода (по четыре «ягдпантеры») и штаб (две самоходки), всего 14 машин в роте. Кроме того, три командирских «ягдпантеры» включались в состав штаба батальона, а общая численность самоходок в последнем должна была составлять 45 машин. Но из-за весьма небольших объёмов производства 654-й батальон и к лету 1944 года не удалось полностью перевооружить истребителями танков «Ягдпантера».
После высадки союзников в Нормандии 6 июня 1944 года 654-й батальон в спешном порядке стали готовить для отправки на Западный фронт. 11 июня в докладе Гитлеру о состоянии части говорилось, что штаб с 1-й и 2-й ротами 654-го батальона стоит под Ретелем в боевой готовности, но в его составе имеется всего 8 «ягдпантер» и пять ремонтно-эвакуационных танков «Бергепантера», которые использовались для тренировок механиков-водителей.
Только 14 июня 1944 года Управление вооружений отправило железнодорожным транспортом 17 новых самоходок в состав 654-го батальона. Однако не дожидаясь получения этого пополнения, в 0.10 15 июня вторая рота 654-го батальона погрузила 8 имеющихся у неё «ягдпантер» на железнодорожные платформы и отправилась на Западный фронт. После нескольких ночных маршей рота достигла пункта назначения, где вошла в состав Учебной танковой дивизии. С 27 июня и до начала июля «ягдпантеры» находились в распоряжении 47-го танкового корпуса и вели бои с английскими танковыми подразделениями.
В своей сводке от 1 июля 1944 года штаб 654-го батальона сообщил об имевшихся у него 25 «ягдпантерах». Всё это время оставшиеся на месте прежней дислокации часть 2-й и 3-я роты использовали прибывшие 17 самоходок для тренировки экипажей. А 1-ю роту перебросили на полигон Малу-ле-Камп без матчасти. Здесь она находилась четыре недели, но самоходок так и не получила.