Вернувшись в Пекин, император Канси мимоходом спросил о делах регулирования рек. Зная, что там есть проблемы, он приказал Цзинь Фу снова стать Главным директором работ по укреплению Хуанхэ и по содержанию Императорского канала. Цзинь Фу доложил: «Я уже стар и болен, пусть этим делом все-таки другие занимаются». Император Канси не согласился, и больному Цзинь Фу осталось только принять должность. Он хотел как можно скорее оправдать Чэнь Хуана, поэтому написал доклад, в котором говорил о больших заслугах Чэнь Хуана и о том, что нужно восстановить его славу. Император Канси отправил людей для вторичной проверки. Цзинь Фу прослужил только больше полугода, как вдруг умер от тяжелой болезни. После его смерти никто не занимался делом Чэнь Хуана. К счастью, все написанные Чэнь Хуаном книги о регулировании рек сохранились, а о его успехах и достижениях помнят потомки! Когда император Канси узнал, что Цзинь Фу умер, то начал беспрерывно вздыхать. Как и первого Юй Чэнлуну, он наградил Цзинь посмертным титулом попечителя наследника престола. Второй Юй Чэнлун продолжил руководить регулированием рек и действовал в соответствии с методами Цзинь Фу. А император Канси опять занялся Галданом.
Император Канси производит инспекторский осмотр Монголии Южной и Северной Гоби и проводит церемонию военного парада
В 1696 году император Канси второй раз лично повел войска в поход, разделив армию на три направления, чтобы дать отпор мятежным войскам. Он пошел по центральному пути, военачальник Сабсу отправился по восточному пути, полководцы Фэй Янгу и Сунь Сыкэ — по западному. Увидев, что по центральному пути идет император, Галдан не решился ввязаться в бой, он снялся с лагеря и убежал. Он не предполагал, что путь ему преградит армия западного направления. Бой между двумя сторонами разразился в Дзун-Моде (к юго-востоку от Улан-Батора в Монголии). Битва была ожесточенной! Проще говоря, цинская армия одержала совершенную победу, и главные силы мятежных войск были уничтожены. Галдан обратился в бегство вместе с несколькими сопровождающими, многие подчиненные также разбежались. Император Канси послал людей, чтобы склонить их к капитуляции, но Галдан все равно не повиновался.
На следующий год император Канси в третий раз лично повел войска в поход в Нинся за пределы горного хребта Хэланьшань с целью преследования. В то время у Галдана осталось всего несколько сотен человек, у них не было провизии, поэтому они даже убивали своих лошадей, чтобы не умереть с голоду. Он хотел обратиться к покровительству России, но Россия не согласилась. Добежав до местности Ачаамутатай в Северной Гоби, ему оставалось только выпить яд (некоторые говорят, что он был убит), его племянник Цэван-Рабдан передал его прах цинской армии.
Третий военный поход против Галдана, возглавляемый императором Канси, наконец-то принес мир северной границе. После этого он четвертый раз поехал с инспекционной поездкой на юг, чтобы проверить регулировку рек. За десятки лет этот император не знал покоя и никогда толком не отдыхал, он только неустанно везде носился и решал государственные дела, что получалось у него превосходно. Но на склоне лет его здоровье уже не было таким крепким, а его сыновья вызвали много неприятностей, и в связи с этим у него появилась страшная болезненная подозрительность.
Борьба между наследниками престола
У императора Канси было 35 сыновей и 20 дочерей. Среди них было много тех, кто умер в раннем возрасте, впоследствии осталось 24 сына. И если он желал назначить наследника престола, то ему следовало выбирать из этих сыновей. Кого же выбрать? Император Канси был ортодоксальным, он считал, что назначить преемником следует старшего сына главной жены. Второго по старшинству ребенка Иньжэна родила императрица, поэтому его утвердили в качестве преемника. В то время Иньжэну было два года, и он стал наследником престола. Император Канси приложил много усилий, чтобы воспитать сына. Он пригласил сыну самых лучших учителей, он мечтал о том, чтобы превратить сына в свою копию. Вначале Иньжэн был довольно прилежным, у него были хорошие успехи и в письме, и в боевых искусствах. Когда он подрос, император Канси звал его вместе решать государственные дела, и его сын был чрезвычайно старательным и прилежным. Но в дальнейшем он изменился. Иньжэн считал, что рано или поздно он все равно станет императором, а потому держался высокомерно, кричал на министров и других сыновей императора, постоянно читал им нотации в присутствии императора, кроме того, еще и любил драться. Свои права он приравнивал к императорским, а иногда даже ставил их еще выше, не зная, что они должны быть ниже, чем у императора. Хуже всего было то, что он любил создавать окружение и культивировать среди министров свою мощь и влияние, то есть сколачивал группы во имя достижения своекорыстных целей. Этого император Канси не мог стерпеть.