Дух Нурхаци был поколеблен, и по возвращении в Шэнцзин он тяжело заболел. Он был подавлен, а на его спине вырос большой бугор (говорят также, что он был ранен артиллерийским снарядом). Как ни лечился Нурхаци, но болезнь победила и вскоре он умер. Его восьмой сын, Абахай-Хунтайцзи, занял трон как Великий хан, но также, как и отец, считал династию Мин своим врагом. После празднования Нового года, когда потеплело, он повел свои войска на захват Цзиньчжоу.
Генерала, охранявшего Цзиньчжоу, звали Чжао Ляоцзяо. Он узнал о приближении войск Цзинь и начал приготовления к бою, доложил вышестоящему руководству и запросил подкрепления. Юань Чунхуань чувствовал, что Нинъюань являлся ключевой позицией и не мог покинуть его, поэтому он приказал Цзу Дашоу возглавить войска для поддержки Цзиньчжоу. Цзу Дашоу повел армию в тыл армии Цзинь и внезапно атаковал, разбив армию Цзинь. Чжао Ляоцзяо также приказал обстрелять их с городских стен из артиллерии. Под их совместной атакой армия Цзинь потерпела поражение. Увидев приближение Цзу Дашоу, Хунтайцзи подумал, что Нинъюань пуст, поэтому повёл большую половину своих войск в Нинъюань. Армия Цзинь еле добралась до Нинъюаня, но увидели, что город во всеоружии. Юань Чунхуань прислонился к стене и, распределяя войска, кричал: «Бейте, бейте!». Артиллерийский огонь и стрелы вылетели за пределы крепости, послышался крик Цзиньской армии. Генерал Ман Гуй, затаившийся в засаде за городом, набросился с кавалерией и сразил армию Цзинь. Сам Ман Гуй получил несколько ранений стрелами, но продолжал сражаться. Цзу Дашоу начал погоню с тыла и почти нагнал Хунтайцзи. Все генералы армии Цзинь получили ранения. Раненый Хунтайцзи увидел, что поражение неизбежно, поэтому приказал отступить, чтобы атаковать Цзиньчжоу. В этот момент Чжао Ляоцзяо воспользовался отсутствием армии Цзинь и подготовил войска в Цзиньчжоу к большому сражению. В конце концов, армия Цзинь снова потерпела поражение в Цзиньчжоу. Хунтайцзи, понурив голову, повел людей обратно. В этой «Великой войне за Цзиньчжоу» армия Мин снова одержала победу. Юань Чунхуань, Ман Гуй, Цзу Дашоу и Чжао Ляоцзяо внесли свой вклад.
Однако кто-то из евнухов при императорском дворе специально начал выискивать ошибки Юань Чунхуаня и написал на него жалобу, говоря, что он сам не участвовать в спасении Цзиньчжоу и должен быть за это наказан. Юань Чунхуань был так раздражён, что не нашёл на это слов. Он рисковал своей жизнью, чтобы выиграть битву, но не только не получил благодарности, а еще и был наказан. Какая несправедливость! Подумав, он написал рапорт об отставке и отправился домой. Вскоре после этого Мин Сицзун умер и наступила эра правления нового императора. Мин Сыцзун подавил партию евнухов. Он постоянно возвращался мыслями к войне в Ляодуне и чувствовал, что Юань Чунхуань был лучшим в битве против армии Цзинь. Он решил, что без помощи Юань Чунхуань ему не обойтись. Он немедленно приказал позвать Юань Чунхуаня.
Генерал, которому то верили, то подозревали
Император Мин Сыцзун решил передать управление Ляодуном и его окрестностями Юань Чунхуаню. Он был очень щедр и не только назначил Юань Чунхуаня министром обороны, но и начальником контрольного приказа Цзяньцзофу (отвечал за инспектирование), генерал-губернатором Цзичжоу и генералом Ляодун, а также управлять военными делами городов Дэнчжоу, Лайчжоу (оба на Шаньдунском полуострове) и Тяньцзинь. Так у Юань Чунхуаня была и военная, и инспектирующая власть. В его ведомстве был не только Ляодун, но и Тяньцзинь с севером Шаньдуна, и он мог распределять человеческие ресурсы.