В 1966-м «Интер» защитил свой титул чемпионов Серии «А», а в Европе дошел до полуфинала Кубка чемпионов, где проиграл мадридскому «Реалу», будущему обладателю своего шестого трофея. Но сезон 1966/67 закончился горьким поражением в финале главного клубного турнира Старого Света в Лиссабоне, где итальянцев сокрушил «Селтик» Джока Стейна, отыгравшийся после раннего пенальти, забитого Маццолой. Португальские газеты емко подытожили это поражение:
Итальянская пресса обвиняла в поражении самого Эленио, утверждая, что тот измотал своих игроков тренировками и психологической подготовкой. Перед матчем клуб забронировал отель на набережной, неподалеку от въезда в Лиссабон. Бурньич рассказывал, что в здании не было ни одного человека, кроме игроков, тренеров и обслуживающего персонала. Даже официальный представитель клуба остановился в другом месте. В подобных условиях футболисты провели три дня.
«В таких обстоятельствах любой нормальный человек сошел бы с ума. После многих лет совместной работы мы привыкли ко всему, но к тому моменту даже мы достигли своего предела».
В чемпионате Италии «Интер» проиграл «Ювентусу» в последнем туре и потерял Скудетто, а после пятого места в Серии «А» в следующем году Эррера покинул команду, перебравшись в «Рому». В столичном клубе аргентинец уже не смог достичь того же успеха, который сопутствовал ему в «Интере», завоевав лишь Кубок Италии в 1969-м. В том году один из игроков Эрреры, Джулиано Таккола, был госпитализирован с тонзиллитом и перенес операцию, а через месяц травмировал локоть и не мог играть. Несмотря на плохое самочувствие, тренер заставил футболиста поехать с командой в Кальяри, где он тренировался вместе с остальными в холодную погоду. Таккола смотрел матч с трибун, а после игры потерял сознание в раздевалке и скончался в машине «Скорой помощи» по дороге в больницу. В начале 2000-х брат Маццолы Ферруччо обвинил тренера в его смерти, утверждая, что ее причиной послужил допинг, который игроки употребляли по настоянию Эрреры. Никаких доказательств этому не нашли.
В 1973-м аргентинец покинул «Рому», чтобы провести неудачный сезон в «Интере», в концовке которого он перенес сердечный приступ, обвинил в нем общественное давление и стресс и поклялся бросить тренерскую карьеру. Но четыре года спустя Эррера все же вернулся к работе, возглавив скромный клуб «Римини», а через год вернулся в «Барселону», с которой завоевал Кубок Короля, прежде чем окончательно уйти в отставку.
На пенсии он жил на острове Маццорбо, к северу от Венеции, много писал для газет и журналов, давал интервью и изредка выбирался на публичные мероприятия.
9 ноября 1997 года Эррера умер, завоевав за свою тренерскую карьеру 17 трофеев, в том числе 6 международных, и навсегда оставшись в истории итальянского и европейского футбола как один из лучших тренеров всех времен. Джани Брера написал 35 лет назад:
«Честно говоря, я понятия не имею, удалось ли ему показать все его стороны, но для меня всегда оставалось самым главным то, что он никогда не был неискренним, даже когда пытался заставить себя сфальшивить. Эленио Эррера всегда был настоящим, пусть и не всегда нам это нравилось».