Неожиданно для многих Ющенко назначил на пост Секретаря СНБО Раису Богатыреву — представительницу Партии регионов. Очевидно, сделал он это для создания противовеса Тимошенко, тем более что в парламенте должен был рассматриваться новый Закон о кабинете министров, значительно расширяющий полномочия президента через СНБО.
Правительство представило в парламент законопроект «О государственном бюджете Украины на 2008 год и внесении изменений в некоторые законодательные акты Украины», который был принят во втором чтении буквально накануне Нового 2008 года. В середине января Тимошенко представила в Верховную Раду свою программу «Украинский прорыв: для людей, а не для политиков», носившую скорее популистский характер и не содержащую программу практических мероприятий по улучшению благосостояния украинского народа. Во время избирательной кампании эта программа была представлена как предвыборная и называлась «Украинский прорыв: к справедливой и конкурентоспособной стране». При этом многие обвиняли Тимошенко в плагиате, поскольку само название было взято из книги бывшего премьер-министра Украины и бывшего секретаря СНБО Анатолия Кинаха с таким же названием. Правда, Анатолий Кинах не обиделся, назвав это «конструктивным плагиатом».
Представленная Тимошенко программа была подвергнута всесторонней критике на заседаниях комиссий, и, прежде чем ее утвердить на пленарном заседании парламента, в нее внесли свыше 300 поправок. При этом критики считали, что программа страдала отсутствием конкретных сроков ее исполнения и финансовой обеспеченности. Тем не менее приоритетными задачами правительства, согласно программе, оставались увеличение зарплат и пенсий, развитие промышленности, усиление борьбы с коррупцией. Кстати, именно повышение зарплат и пенсий остались в памяти людей спустя годы после ухода Тимошенко, хотя было одно популистское обязательство. Речь идет о выплате по 1000 гривен вкладчикам бывшего Сбербанка СССР как компенсации за потерю сбережений из-за начавшейся в СССР гиперинфляции. Понятно, что обещание правительства выплатить населению порядка 200 дол. на бывшего вкладчика было воспринято населением с энтузиазмом. Со временем желающие оформили банковские карточки, на которые должны были быть переведены деньги. Но на это ушли годы.
В 2008 году Тимошенко вновь с большим рвением взялась за программу пересмотра результатов приватизации. В списке компаний, предложенном Кабинетом министров, были такие крупные промышленные объекты, как Одесский припортовый завод и «Укртелеком», против приватизации которых Тимошенко выступала в годы своего первого правительства. Предполагалось реприватизировать также Луганский тепловозный завод. Как и прежде, Ющенко попытался приостановить реприватизации и обратился к правительству с просьбой ничего не предпринимать до принятия закона Украины «О государственной программе приватизации» и выработки согласованного подхода всех ветвей власти к приватизационному процессу. В целом согласившись с президентом, Тимощенко внесла в закон существенные поправки. Суть поправок она сформулировала на брифинге в Кабинете Министров 23 января 2008 года: «Мы хотим, чтобы в законе появилась норма, что при невыполнении условий приватизационного договора, такой приватизационный договор будет расторгаться без возврата тех денег, которые заплатили за предприятие».
В январе 2008 года в стране разразился очередной политический кризис, связанный с тем, что министр иностранных дел Владимир Огрызко во время встречи в штаб-квартире НАТО в Брюсселе 18 января вручил ее генеральному секретарю письмо, подписанное президентом Виктором Ющенко, премьер-министром Юлией Тимошенко и спикером парламента Арсением Яценюком, о стремлении Украины присоединиться к «Плану действий относительно членства в НАТО» на саммите в Бухаресте в апреле 2008 года. Содержание этого письма до его отправки в Брюссель не было доложено кабинету министров и депутатам Рады. Общественное мнение Украины в вопросе о вступлении в НАТО было расколото. И это дало основания фракциям коммунистов и регионалов в парламенте выступить с резкой критикой в адрес Ющенко, Тимошенко и Яценюка. В написанном ими 21 января 2008 года заявлении, в частности, указывалось: