Во время царствования Федора Романова на Руси стали возникать первые конские заводы. Царь поощрял разведение красивых породистых лошадей, чтобы были «не хуже голштинских», как он часто говаривал. Преобразили при этом царе Кремль — святая святых Москвы. К тому времени все дворцы Кремля были уже каменными, улучшилось внутреннее убранство дворцовых палат: на скамьях и столах дорогие ткани, стены и полы украшены мозаикой. Федор велел завезти и посадить на территории Кремля розы, не виданные до того времени в Московии, разве что в саду его батюшки в Измайлове, и украсить кремлевские площади деревьями. На берегах Москвы-реки было велено развести сады, и сам государь уделял много внимания садоводству и цветоводству.
Большую пользу России принес царь Федор отменой местничества, вносившего немало распрей среди вельможных подданных государя. А значило это вот что.
Вся старинная служба предков была записана в книгах, называемых разрядными. И всякий боярин, и вообще знатный служилый человек, не хотел ни при каких обстоятельствах быть ниже того, чей отец не являлся более знатным, чем его отец, то есть хотя бы несколько дней занимал более низкое положение по отношению к его предку. Это считалось покушением на его честь. Иногда доходило просто до смешного. Например, на царских приемах какой-нибудь боярин не хотел садиться после тога, кого он считал менее знатным. Царь же порой велел ему занять то место, на которое он укажет, не считаясь с принципом местничества. Тогда боярин, чтобы не выглядеть человеком, честь которого затронута, притворялся больным и уезжал домой, а иногда даже забирался под стол, чтобы не позволить себя «обесчестить». Бывали случаи, что за это ослушание государь наказывал даже высокопоставленных бояр.
Вред от местничества был немалый: в армии, в провинциальных ведомствах, в самой Москве при царском дворе, поскольку при назначении на должность боярина или дворянина прежде всего следовало считаться с заслугами его предков. Этот обычай был непреодолимым препятствием для целесообразного подбора способных людей и неиссякаемым источником споров и ссор. Поэтому третий царь Романов созвал собор бояр и церковных сановников, объяснил все беды, исходящие от местничества в России, и приказал навсегда покончить с ним. Разрядные книги были сожжены. Знатные дворяне были занесены в родословную книгу только для того, чтобы помнить заслуги предков, сохранить их в памяти. Эти книги велись в течение всего правления Дома Романовых. Дворянское звание отныне давалось за особые заслуги перед царем и государством. До отмены местничества самыми знатными на Руси были князья и бояре. Княжеское достоинство переходило от отца к сыну, а боярство государь жаловал, и этот титул также сохранялся за потомками.
Любые нововведения воспринимались русскими с опаской, но здесь обошлось без особых трений. А вот в царской семье при Федоре Алексеевиче было неспокойно. Явная борьба велась между царицей Натальей Нарышкиной, мачехой царя, и его сестрами и тетками, поддерживаемыми всей родней первой жены царя Алексея Михайловича — Милославскими. Последние взяли верх, следствием чего явилось падение Матвеева, верного слуги бывшего царя, дяди и приемного отца Натальи Нарышкиной. Как приверженец западной науки, он был обвинен в магии и сослан на север. Оклеветан был и пастор Грегори, развивающий театральное искусство в Москве. Его выслали из России.
Удаление Матвеева и его ссылка глубоко огорчили вдову второго царя Романова; она понимала, что пострадал боярин за свою преданность, и удар был направлен прежде всего против нее. Наталья уединилась в своих кремлевских покоях и предалась полностью воспитанию своих маленьких детей.
Безрадостная жизнь вдовствующей царицы продолжалась в течение почти всего правления сводного брата ее сына. Царь Федор изредка посещал ее уединенные хоромы, был с ней ласков и милостиво относился к своему бойкому смышленому брату. Он любил смотреть на игры мальчика, говорить с ним и не скрывал своего восхищения необыкновенными способностями ребенка. По его приказанию для царевича написали букварь и часослов крупным шрифтом с картинками; книги переплели в красный бархат. Царь считал, что мальчику, которому уже пошел шестой год, пора учиться, и сам стал следить за его образованием. Сам же и выбрал царевичу достойного учителя и даже присутствовал на его первом уроке. Федор с уважением относился к своей мачехе, но по слабости характера не защищал ни ее лично, ни ее родственников от нападок со стороны царедворцев, подстрекаемых Милославскими.