Сложные задачи пришлось решать в Дальневосточной кампании и ветеринарной службе действующей армии. Маньчжурия, Внутренняя Монголия и Корея, а также войска противника в эпизоотическом отношении были крайне неблагополучными. В течение трех лет, предшествовавших наступлению советских войск, в японской Квантунской армии насчитывалось свыше 8 тыс. лошадей, больных инфекционной анемией. Большинство из них пало или было уничтожено японской ветслужбой. Но и после этого нередко отмечались заболевания лошадей анемией, сапом и чумой. Кавалерийские и гужтранспортные части противника были укомплектованы лошадьми, конфискованными у населения Маньчжурии и Внутренней Монголии, среди которых сап имел широкое распространение. Например, в Чаньчуньской, Харбинской и Мукденской провинциях зараженность лошадей сапом достигала 30–40 процентов. Во всех провинциях имели место заболевания крупного рогатого скота чумой. Владельцы больных животных, как правило, забивали их на мясо и свободно торговали им на рынке, в силу чего чума крупного рогатого скота беспрепятственно распространялась по территории всей Маньчжурии и за ее пределы. Ветеринарная служба Японии противочумные прививки животным проводила только в местах заготовки скота и мяса. Разумеется, эти частичные мероприятия не могли уничтожить заболеваний скота чумой. В ряде случаев крупный рогатый скот в названных районах болел ящуром, а свиньи — чумой и рожей.
Крайне опасная эпизоотическая обстановка требовала от ветеринарной службы фронтов и армий больших усилий по поддержанию ветеринарного благополучия конского состава и надежной защите войск, по предотвращению заноса эпизоотий на территорию Советского Союза.
Чтобы не допустить проникновения чумы крупного рогатого скота на территорию СССР, вдоль всей государственной границы была создана пограничная иммунная зона. Силами и средствами ветеринарной службы армий и фронтов совместно с гражданской ветеринарной службой всему крупному рогатому скоту в этой зоне (шириной 30 км) произведены прививки. На советско-китайской, советско-монгольской и советско-корейской границе осуществлялся строгий карантинный режим. Был установлен тщательный контроль за заготовками скота из местных ресурсов. Использование трофейных продовольственных животных на мясо допускалось лишь на специальных, соответственно оборудованных мясокомбинатах. Вывоз лошадей и других животных на территорию СССР не допускался.
В результате проделанной работы эпизоотии не перешагнули рубежи нашей Родины. В ходе операции на Дальнем Востоке (за август и сентябрь 1945 г.) амбулаторная заболеваемость лошадей составила 9,5 процента, а стационарная — 10,4 процента их списочного состава. При этом эксплуатационные болезни составили 58,2 процента общей заболеваемости, заразные болезни — 10,4 процента и боевые поражения — 6,1 процента.
Преобладание эксплуатационных заболеваний объясняется очень большой нагрузкой, которую пришлось нести лошадям при ограниченных возможностях обеспечения их фуражом и водой. В отдельные дни лошади, особенно в Забайкальском фронте, получали только по 3–4 л воды в сутки. От водного голодания многие из них быстро худели, не принимали пищу; часто наблюдались тепловые удары, нередко кончавшиеся падежом. Однако эффективность лечения лошадей по названной группе заболеваний была высокой. Она составила 97 процентов всех лошадей, подвергшихся эксплуатационным заболеваниям.
Боевые поражения лошадей в ходе операции были сравнительно незначительными. Они имели место в основном в первые дни операции, когда советские войска преодолевали мощные укрепления противника. Выздоравливаемость лошадей по группе боевых поражений достигла 92,9 процента.
Особую значимость в ходе операции приобрела надежная охрана и оборона тыла. Как известно, одним из «особых» средств ведения войны в японской армии являлись смертники-диверсанты, часть которых специально готовилась для уничтожения мостов, складов и других важных тыловых объектов. Кроме того, японское командование создавало специальные «летучие отряды», сформированные из отборных солдат и офицеров — ярых фанатиков. Скрываясь в лесах и горах, они должны были совершать диверсии, нападать на коммуникации и отдельные гарнизоны, дезорганизовывать работу войскового и оперативного тыла.
Все это потребовало проведения специальных мероприятий. Для руководства охраной и обороной тыла во всех соединениях фронтов были назначены начальники охраны войскового тыла. В их распоряжении имелись специально выделенные подразделения, которые широко использовались для прочесывания местности и ликвидации различных банд и диверсантов. Большую помощь в ликвидации оставленных японским командованием в тылу советских войск банд и диверсионных групп оказало советским войскам местное китайское и корейское население.