При разделе Речи Посполитой Беловежская Пуща вошла в состав государственных земель Российской империи, хотя Екатерина II, как и польские короли, раздала часть земель своим приближенным. Первое время после перемены власти в Пуще появилось много браконьеров, казна и сама раздавала лицензии на отстрел животных. В 1802 году Беловежская Пуща из Литовско-Гродненской губернии перешла в ведение департамента государственных имуществ министерства финансов. Сохранился указ императора Александра I Литовскому губернатору от 10 сентября 1802 года:
«По редкости находящихся в Беловежском лесе зверей, так называемых зубров, признал я за благо для охранения их от битья и пуганья и для прокормления, приписать по-прежнему деревни Цвирки, Панасюки, Каменюки и Мозынари Пауцкие. Вследствие чего повелеваю вам, сообразя местные обстоятельства, положить на мир и представить на утверждение Правительствующему Сенату, какое облегчение вместо сей повинности должно сделать крестьянам».
Многое для Беловежской Пущи сделал известный деятель того времени Антон Тизенгаузен – «он очистил хозяйственным образом все орошающие Пущу реки и речки от массы поваленных деревьев; русла их регулировал, а реку Нарев соединил с Наревкой посредством канала».
С 1803 года доступ в Беловежскую Пущу стал осуществляться по специальным разрешениям, а охота на зубров – по разрешению императора России. С 1820 года в Пуще была запрещена рубка деревьев. В 1833 году в Беловежской Пуще работала особая комиссия, разделившая Пущу на 540 двухверстных участков и назначившая 180-летний срок – график рубки леса – тогда в Пуще насчитали до 300 000 высохших или поваленных деревьев, мешавших молодой поросли.
В 1860 году в Беловежской Пуще охотился император Александр II. Осенью две тысячи крестьян провели облавы для загона зубров, лосей, кабанов, ланей, волков, лисиц, зайцев. Крестьянские облавы загнали зверей в засеку в семь квадратных верст. На просеке – линии огня – для царствующих охотников было приготовлено двенадцать небольших закрытых галерей-гигантов, защищенных от нападения деревьями. Ф. Глинский писал:
«Император, заняв штанд, приказал подать сигнал для начала охоты. Облава сдвинулась сгонять зверей к штандам. В это время лесная стража спустила своры гончих. Вскоре из гущи леса выбежало несколько громадных зубров. Раздался выстрел, и один из самых больших пал замертво, раненый метким выстрелом Государя. Вслед за тем Государем на расстоянии 75 шагов был убит пулей в лоб еще один зубр, и тогда уже послышался град выстрелов других охотников, которые стреляли и в прочих крупных зверей и даже в барсуков и зайцев, когда не было зубров. Целых два часа ружейный огонь не прекращался ни на минуту.
В этот день было убито 444 зверя; из них императором 22 штуки. Всего же за два дня царской охоты, 6 и 7 октября, пало: 28 зубров, 2 лося, 10 ланей, 11 кабанов, 16 волков, 7 лисиц, 4 барсука и 2 зайца».
В 1889 году по императорскому указу Беловежская Пуща перешла в ведение царского двора – удельного ведомства и стала частным владением семьи Романовых, которым занималось Управление Беловежской Пущей.
В Пуще был построен великолепный дворец, охотничий павильон и зверинец, В 1887 году к Управлению Пущи в селе Беловеже была проведена железная дорога от Бельска.
В этом же году в Беловежскую Пущу приезжали две экспедиции ученых – естествоиспытателей Блонского, Дриммера и Эйсмонта. Они собрали и описали 300 видов грибов, 120 видов мхов, 10 папоротников, 700 растений. Ученых поразили дубы шестиметровой толщины, тис обыкновенный, белая ель, обилие птиц и животных и, конечно, зубры.
Впервые зубра или тура описал древнегреческий мыслитель Аристотель за три века до нашей эры, под именем Bonasos. Византийцы называли его Zombtos. Дикий бык зубр упоминается в скандинавских сагах, в «Песне о Нибелунгах» как эталон силы, отваги, храбрости.
В 1523 году в Кракове на латинском языке были напечатаны сто экземпляров книги М. Гусовского «Песня о зубре»:
«Этот крайне дикий зверь водится в литовских лесах и доходит до таких размеров, что если когда-либо, умирая, он откинет голову назад, три мужа могут сидеть между его рогами. Борода его ниспадает взъерошенными, низко висящими космами, страшные глаза краснеют от ярости, и густая грива с шеи падает на плечи, покрывая собой темя, колени и нижнюю часть груди. Но если пожелать сравнить великое с ничтожеством, то, выражаясь словами охотников, наружный его вид напоминает косматого козла, хотя все члены изображают собой быка. Цвет его темен: бурое до того сливается с черным, что выходит нечто среднее между обоими оттенками.