Соседний двухэтажный дом № 39 с рустованным нижним этажом в 1900 г. перестроен архитектором И. В. Вольфом. Дворовый корпус возведен в 1905 г. по проекту П. В. Резвого. В вечернем выпуске «Красной газеты» за 22 августа 1923 г. напечатана заметка: «Несчастная! Гр. Иванова (Карповка, 39) занимает квартиру в пять комнат, по-царски обставленную, свиней белыми булками кормит, что не мешает ей иметь листок безработной за № 172020/12851. Забокржицкая». Под этой заметкой напечатано: «От редакции. Проверено».
Впритык к нему стоял дом № 41, в котором находилось общество в память отца Иоанна Кронштадтского.
За этими домами — здание школы (дом № 43) в классицистических формах, поставленное в глубине сквера. Оно возведено в 1935 г. по проекту архитекторов А. А. Юнгера и А. Н. Сибирякова.
На противоположной стороне Вяземского переулка, на земле, часть которой была купленной, а часть пожертвованной потомственным почетным гражданином С. Г. Раменским, 8 мая 1900 г. освятили место для подворья Иоанно-Богословской женской общины. Она создана в 1899 г. на реке Пинеге, в селе Суре — родном селе Иоанна Кронштадтского. В 1900–1903 гг. по проекту епархиального архитектора Н. Н. Никонова возведен в византийском стиле комплекс зданий Иоанновского женского монастыря (дом № 45). На небольшом участке неправильной конфигурации удалось разместить храм, жилой флигель, корпус келий, мастерские, лазарет. Основателем монастыря был протоиерей И. И. Сергеев (Иоанн Кронштадтский). Закладка подворья состоялась 16 сентября 1900 г. 17 января 1901 г. внизу освятили церковь преподобного Иоанна Рыльского — Иоанн Кронштадтский родился в день его памяти. В том же году община обращена в монастырь, а подворье — в самостоятельную обитель.
17 декабря 1902 г. освятили главный, занимавший два верхних этажа храм.
В 1907 г. в подвальном этаже по проекту Никонова подготовлена небольшая церковь-усыпальница. 21 декабря 1908 г. ее освятил митрополит Антоний во имя пророка Илии и святой царицы Феодоры, чьи имена носили родители Иоанна Кронштадтского. 22 декабря 1908 г. в ней был погребен Иоанн Кронштадтский.
31 августа 1913 г. митрополит Санкт-Петербургский и Ладожский Владимир обратился к обер-прокурору Св. Синода с просьбой о разрешении построить на участке монастырской земли храм с усыпальницей на 500 мест для почитателей и благотворителей обители. Строительству его помешала начавшаяся война. 20 мая 1916 г. получено разрешение врачебного инспектора на устройство склепов в монастырском саду.
При монастыре, ставшем в 1909 г. первоклассным, имелся приют для девочек, лазарет и иконописная мастерская. К началу 1919 г. в обители жили 24 сестры и 43 послушницы. В 1920 г. сестры образовали приход, который ликвидировали в октябре 1923 г.; церковь отдали под клуб. Спустя два года остальные здания, где еще жили около 60 монахинь, отдали Мелиоративному институту. 1 марта 1926 г. вход в усыпальницу Иоанна Кронштадтского замуровали.
В апреле 1926 г. комиссией при осмотре склепов в монастырском саду составлен акт. В нем есть сведения о том, что на этом кладбище похоронены сын камергера Высочайшего двора князь А. А. Щербатов и подпоручик лейб-гвардии 4-го стрелкового Императорской фамилии полка князь Г. С. Васильчиков, погибший 5 июля 1915 г. в бою под Красноставом. 10 декабря 1915 г. здесь похоронили А. В. Адлерберга, губернатора Пскова, в 1911 г. — петербургского губернатора. 18 января 1916 г. на кладбище погребена вдова тайного советника М. Н. Калугина, 20 марта 1916 г. — уездный предводитель дворянства Харьковской губернии светлейший князь А. К. Горчаков, внук великого канцлера. Он отправился в действующую армию помощником уполномоченного 8-го передового отряда Красного Креста. 5 марта 1916 г. был тяжело ранен. 13 марта его привезли в Петроград, в Юсуповский лазарет, где он 18 марта скончался. 30 марта 1916 г. на монастырском кладбище состоялось последнее захоронение: видного общественного деятеля, члена Государственного совета гофмейстера М. И. Миклашевского. Последние годы он был директором Английского собрания, принимал участие в особом комитете по усилению военного флота на добровольные пожертвования.
В последующие годы в монастырском здании сменилось много арендаторов: заводские общежития, НИИ физкультуры, учебный центр вычислительной техники, государственный институт по проектированию гидротехнических сооружений «Гипровод», театр «Лицедеи», городская радиотехническая школа ДОСААФ. Здесь же были жилые квартиры. В одной из них жил заместитель управляющего Сестрорецким заводом имени Воскова С. А. Митревич.
В 1989 г. монастырь возвратили верующим. В нем разместилось подворье Пюхтицкого монастыря, которое начало восстановление храма. В 1999 г. по проекту архитектора А. П. Викторова восстановили часовню во имя Серафима Саровского (возведена в 1910–1911 гг.), снесенную в советское время.