12 ноября на разведку немецких войск в оккупированном Тихвине вылетела пара в составе лейтенанта Н. Кочегарова и младшего лейтенанта Ф. Янченко. Николай Васильевич Кочегаров и Филипп Семенович Янченко были опытными летчиками, участвовавшими в Великой Отечественной войне с первых дней. Пара подошла к Тихвину с северо-запада на бреющем полете. Немцы встретили их сильным заградительным огнем. Кочегаров решил развернуть свою пару, чтобы выйти из зоны интенсивного огня, но на развороте, когда между самолетами было минимальное расстояние, зенитный снаряд попал в самолет Янченко, который подбросило так, что он ударился об самолет Кочегарова. Оба истребителя упали в пригороде Тихвина. При ударе о землю Янченко погиб, а Кочегаров в тяжелом состоянии, с перебитыми ногами, был подобран советскими женщинами, жительницами Тихвина. Его спрятали в сарае, как могли оказали первую помощь. Укрыв летчика, женщины, боясь появления немцев, ушли. На следующее утро они пришли навестить раненого летчика, но Кочегаров был уже мертв. Похоронили его в этом же сарае…
14 ноября 1941 года при отражении вражеского налета на г. Волховстрой в бою против 4 Ю-88 погиб летчик Петр Николаевич Цветков. Сражаясь против превосходящего по численности противника, Цветков заставил его сбросить бомбы не по цели и повернуть обратно. Раненный в ноги, Петр Цветков разбился при вынужденной посадке в 2 км восточнее деревни Колчаново Волховского района Ленинградской области. С начала войны Цветков совершил 268 боевых вылетов. Жители деревни Колчаново, на глазах которых проходил бой, похоронили героя летчика во дворе местной школы…
Аэродром Новая Ладога стал объектом частых налетов вражеской авиации. Бомбили в основном по ночам. Бросали фугасные и зажигательные бомбы. В одну из таких ночей несколько зажигательных бомб угодили в капонир, где стоял самолет техника А. Наумова. Начался пожар. Подоспевшие люди бросились на борьбу с огнем, а сверху со свистом сыпались бомбы. Невзирая на опасность, воины выкатили из огня боевой самолет.
В декабре эскадрилья пополнилась опытными боевыми командирами звеньев, бывшими летчиками 13-го ИАП старшими лейтенантами Д. М. Шаровым и К. П. Присяжнюком. Оба были участниками боев с белофиннами, у обоих — по два ордена. Они пришли из госпиталей после ранений, полученных в боях. Шаров был сбит немецкими истребителями в районе деревни Гостилицы после того, как его звено успело сбить 2 Ю-88. При спуске загорелся парашют, но тяжело раненный летчик остался жив. Константин Присяжнюк тоже был сбит в воздушном бою, тоже покидал горящую машину и пострадал еще больше, чем Шаров. У него сильно обгорели лицо и обе руки. Теперь они снова вернулись в строй.
А в январе 1942 года командира 13-й ОКИАЭ Героя Советского Союза майора A. A. Денисова перевели в другую часть, и в командование вступил один из основателей эскадрильи капитан Иван Федотович Сизов.
Старая материальная часть — самолеты И-16, полученные еще перед финской войной, доживали последние дни. Усилиями технического состава, их трудом эти «ишачки» еще ходили в бой. Летчики, не жалея сил и самой жизни, не получая пополнения самолетов, теряя своих боевых друзей, продолжали вылеты с аэродрома Новая Ладога. За период с января по март 1942 года эскадрилья совершила 642 боевых вылета на прикрытие Дороги жизни. 18 марта 1942 года по приказу командования 13-я ОКИАЭ под командованием капитана Сизова перебазировалась в глубокий тыл, в город Рузаевку Мордовской АССР, для переучивания на новую материальную часть.
13-я ОКИАЭ возвращается на фронт
Преобразование 13-й ОКИАЭ в 13-й ИКАП
16 ноября 1942 года, закончив переучивание на новую материальную часть и пополнившись летным составом, эскадрилья без самолетов убыла на аэродром Новинка. Он разместился в 18 километрах к югу от станции Пестово (ныне Новгородской области), вблизи деревни Новинка, расположенной на западном берегу реки Мологи. Одноэтажные деревянные дома протянулись одной длинной улицей с юга на север. Аэродром был окружен с трех сторон сосновым лесом. Покров аэродрома травяной; размеры летного поля позволяли производить полеты на всех типах самолетов. С 1942 года здесь переучивались и формировались авиационные части ВВС КБФ.