В 1942 на станции Тоннельная погиб в бою бронепоезд № 53, в Новороссийске был взорван поврежденный бронепоезд № 751 «Свердловский железнодорожник». У моста через Дон в Воронеже в начале июля 1942 были разгромлены немецкими танками и пикирующими бомбардировщиками два бронепоезда 62-го дивизиона – № 14 «Борис Петрович» и № 15 «Бесстрашный». У станции Родаково, близ Ворошиловграда, в июле 1942 был уничтожен немецкими пикирующими бомбардировщиками бронепоезд № 2 «За Родину». В этот же день, 14 июля, западнее Ростова были взорваны своими командами попавшие в окружение бронепоезда 7-го отдельного дивизиона – № 21 и № 29.
В 1942 были потеряны еще ряд бронепоездов. В один день на станции Черемисиново немецкие пикирующие бомбардировщики превращают в груду металлолома бронепоезд № 1 «Челябинский железнодорожник», а у станции мармыжи команда взрывает свой лишившийся хода и потому обреченный «Южноуральский железнодорожник». В этот же день у Щигров, безудержно рвущиеся на восток танки Вермахта, при поддержке авиации, уничтожают бронепоезд № 9 «Дзержинец» из состава 22-го дивизиона. 30 октября 1942 становится последним днем короткой военной биографии бронепоездов № 717 «Оренбургский железнодорожник» и № 731 «Вперед, на Запад!».
Бронепоезд «Смерть фашизму!». Севастополь
Немецкое командование с осени 1941 стало использовать свои бронепоезда в основном для охраны своих коммуникаций и борьбы с партизанами, число которых постоянно росло. Многочисленные диверсии на железных дорогах срывали снабжение германской армии, причиняли множество хлопот. Десятки немецких Panzer Zug патрулировали железные дороги Прибалтики, Белоруссии, Украины и западных районов России, почти ежедневно вступая в огневой контакт с партизанами.
По данным Центрального штаба партизанского движения на железных дорогах Белоруссии в 1943 было пущено под откос 19 немецких бронепоездов. Созданный на базе трофейных польских бронепоездов № 52 «Пилсудчик» и № 54 «Грозный», германский Panzer Zug № 21 дважды подрывался на партизанских минах – 7 октября 1943 и 23 июня 1944. Во время советского наступления 1944 он не успел уйти на запад и 30 октября 1944 был захвачен советскими войсками в литовском городе Мажейкяй. Другой бывший «поляк» – Panzer Zug № 22 в феврале 1945 был уничтожен советскими штурмовиками в польской Шпротаве.
Попытки германского командования использовать бронепоезда в боях с наступающими советскими войсками чаще всего заканчивались для них плачевно. Авиация и танки не оставляли им никаких шансов на выживание. Случались даже тараны. Во время операции «Багратион», советские танковые части подходили к Бобруйску. 25 июня 1944 наступление танкистов застопорилось у станции Черные Броды: немецкий бронепоезд, стоявший на станционных путях, вел непрерывный огонь по советской пехоте и танкам. На бронепоезд пошли в атаку танки. Командир немецкого бронепоезда приказал отходить со станции. Танкистам никак не удавалось вывести из строя паровоз, и бронепоезд уходил. Танк лейтенанта Комарова погнался за составом. В этот момент в танк угодил снаряд с бронепоезда, и он загорелся. Тогда механик-водитель направил горящую машину на бронепоезд. От таранного удара немецкий бронепоезд сошел с рельсов, и был захвачен подошедшей пехотой.
В период проведения операции «Багратион» по освобождению Белоруссии в составе Кр. Армии действовали несколько десятков бронепоездов. Отдельные дивизионы бронепоездов организационно входили в состав общевойсковых армий. На 1-м Прибалтийском фронте сражались бронепоезда 44-го (4-я Ударная армия) и 60-го (43-я армия) отдельных дивизионов. В состав 44-го дивизиона входили бронепоезда уральской постройки № 673 «Котовский» и № 758 «Щорс», а 60-го – башкирские «Салават Юлаев» и «Уфа».
В составе 31-й армии 3-го Белорусского фронта вел боевые действия 52-й отдельный дивизион, 49-й армии 2-го Белорусского фронта – 1-й отдельный дивизион. Больше всего бронепоездов было на 1-м Белорусском фронте – пять дивизионов (в 47-й армии – 31-й (бронепоезда «Кузьма Минин» и «Илья Муромец») и 59-й, в 48-й армии – 39-й, 61-й армии – 40-й (бронепоезда «Киров» и «Североказахстанец») и фронтовой 55-й.
В Кр. Армии, после начала освобождения западных районов страны, многие бронепоезда стали использоваться в качестве подвижных командных пунктов командующих фронтами. Константин Рокоссовский, в период проведения операции «Багратион» по освобождению Белоруссии, постоянно путешествовал по фронту на личном бронепоезде.
Советские бронепоезда дошли и до Берлина. В составе 1-го Украинского фронта в мае 1945 года имелись 21-й, 45-й, 49-й и 58-й отдельные дивизионы бронепоездов.
Освобожденные районы Советского Союза, территория восточноевропейских государств и поверженной Германии находились под пристальным вниманием НКВД. Срочно формировались новые дивизии войск НКВД, в состав которых включались и бронепоезда для обеспечения безопасности железнодорожных магистралей.