Pix набиралось немало. Анализ ситуации, сложившейся на 1 июля, показал, что на железных дорогах Дальнего Востока не хватает угля. Местные ресурсы подошли к концу, и чтобы не сорвать график оперативных перевозок, требовалось получить разрешение ГКО на использование госрезервов, сохранявшихся в неприкосновенности. С отставанием от утверждённого графика шло накопление боеприпасов Медленно продвигались к районам боевых действий транспорты с самолётами. Затягивался ремонт бронетанковой техники. Серьёзно запаздывало комплектование медицинских учреждений.
Обоснованное беспокойство командования Забайкальского фронта вызывало положение в 6-й гвардейской танковой армии. С каждым днём нарастало отставание от графика движения эшелонов с её войсками и техникой.
Особенно остро ощущался недостаток автотранспорта в количестве трёх тысяч автомашин, которые предполагалось получить по месту выгрузки близ станции Даурия и в районе сосредоточения юго-западнее Тамцак-Булака.
Перед самым отъездом в Кремль во вторник, 3 июля, Верховный накоротке встретился на «Ближней даче» с будущим Главкомом дальневосточной группировки маршалом Василевским, ставшим на время кампании, «генерал-полковником Васильевым». Всё указания Сталина были конкретными, продуманными и взвешенными:
— Теперь от вас зависит очень многое, товарищ Василевский, и прежде всего непосредственная подготовка войск. Я скоро убываю в Берлин, на третью конференцию глав союзных государств. Обсуждению подлежат очень сложные вопросы: раздел Германии, контрибуции, новый порядок в Европе. Быстрота вашей операции обеспечит и силу нашего дальнейшего влияния на Дальнем Востоке, в Китае и Корее. Полная готовность войск и сил флота должна быть достигнута не позднее чем через три-четыре недели.
Прибыв утром 4 июля в Читу, ещё официально не назначенный командующим Забайкальским фронтом, маршал Малиновский сразу же приступил к решению неотложных вопросов сосредоточения фронтовых сил. Ровно сутки спустя он получил из рук маршала Василевского директиву Ставки на проведение наступательной операции. Особое внимание в ней обращалось на обеспечение бесперебойной работы железных дорог в границах фронта и прикрытие района сосредоточения главной войсковой группировки. Подготовку совместных наступательных действий войск Забайкальского фронта и Монгольской народно-революционной армии предлагалось закончить к 25 июля.
Верховный не любил неопределённостей и при подписании директивы Ставки приказал особо оговорить в ней порядок наступления войск генерал-полковника Кравченко: «6-й гвардейской танковой армии: действуя в полосе главного удара в общем направлении на Чанчунь к десятому дню операции форсировать Большой Хинган, закрепить за собой перевалы через хребет и до подхода главных сил пехоты не допустить резервов противника из Центральной и Южной Маньчжурии». Такая формулировка исключала сомнения относительно подлинного места танковой армии в оперативном построении фронтовых сил. Она могла находиться только в первом эшелоне наступающих войск и должна была вести за собой остальные армии.
Директива заканчивалась требованием строго соблюдать скрытность всех наших приготовлений: «К разработке плана операции допустить: командующего, члена Военного совета, начальника штаба фронта и начальника Оперативного управления штаба фронта — в полном объёме. Начальников родов войск и служб допустить к разработке специальных разделов плана без ознакомления с общими задачами фронта. Командующим армиями задачи поставить лично устно без вручения письменных директив фронта. Порядок допуска к разработке плана операции армии установить такой же, как для фронта. Всю документацию по оперативным планам действий войск хранить в личных сейфах командующего войсками фронта и командующих армиями».
В первый же день пребывания в Чите маршал Василевский поручил своему штабу организовать всестороннее изучение противника. Однако необходимость строгого соблюдения пограничного режима лишала возможности использовать такие средства и способы разведки, как артиллерийская инструментальная разведка, аэрофотографирование, боевая разведка. Поэтому во фронтах использовались в основном разведывательные данные центра и средства наземного визуального наблюдения. С этой целью в полосе 15-й армии Дальневосточного фронта каждый стрелковый полк имел до двадцати наблюдательных пунктов. В полосе 5-й армии Приморской группы войск было организовано почти шестьсот наблюдательных пунктов, с которых территория противника просматривалась на глубину до шести километров.
Была организована широкая сеть радиоперехвата. Радиоразведка круглосуточно работала и в штабах фронтов. С целью детального изучения оборонительных сооружений противника проводилось фотографирование приграничной полосы его обороны с самолётов без нарушения границ Маньчжурии и Кореи. Аэрофотографирование дало возможность полностью уточнить укрепления японцев в глубине до пятнадцати-двадцати километров.