Сведения о дальнейшей судьбе Мани противоречивы. По одним данным, он пользовался благосклонностью Шапура и спокойно проповедовал до самой его смерти и даже некоторое время после нее. По другим свидетельствам, Мани был вынужден скитаться, так как его периодически изгоняли из Ктесифона и даже несколько раз сажали в тюрьму. В итоге, обвиненный жрецами в ереси, он был схвачен и вскоре погиб. Некоторые источники утверждают, что его забили камнями, другие — что он умер от болезней и лишений в тюрьме.
Чем же так не угодил жрецам Мани? Почему христиане считали его еретиком? Почему его вера, распространившаяся от Рима и Константинополя до Индии и Китая, подвергалась гонениям во всех этих странах?
В основе манихейства лежит необычайно глубокая по смыслу легенда. В ней говорится, что существуют бог добра и бог зла. Долгое время мир пребывал в равновесии. Но однажды духи тьмы задумали предпринять штурм царства света. И они достигли его границ, но овладеть им не смогли. Силы света решили наказать демонов. Но в царстве света не было зла! Потому демоны могли быть наказаны только чем-то добрым. Духи царства света взяли одну часть своего царства и примешали его к материальному царству тьмы, в результате чего в мире зла возник новый элемент — смерть. И с тех пор зло неизбежно пожирает само себя. Благодаря этому возник человек. Отныне он должен не отрицать зло, а превращать его в добро. Зло в понимании манихеев есть добро, поставленное не на свое место, не в соответствующее ему время.
Кстати, манихейство делило все время существования человечества на три эпохи. «Первое время» было, когда два изначальных принципа — добро и зло, свет и тьма — существовали отдельно друг от друга. Пространственно добро занимало север, восток и запад, зло — юг. «Второе время» — смешение двух принципов: зло вторгается в царство света. Владыка светлого царства порождает матерь жизни, а та — первочеловека Христа, который вступает в борьбу с сынами мрака, но терпит поражение и попадает в плен. Для Его спасения владыка порождает духа живого, который, победив воинство тьмы, создает космос для очищения света, поглощенного ими. Когда очищение света от материи завершится, наступит «третье время» — время торжества добра над злом; остатки материи, лишенные Божественного света, погибнут во вселенском пожаре, который будет пылать 1468 лет. Те, кто останется жив, образуют новый мир добра и света.
Манихейство истолковало библейскую идею таким образом, что получилось будто дьявол запрещает человеку вкушать от древа познания добра и зла, а бесстрастный Иисус учит человека сорвать запретный плод и раскрывает ему тайну духовного происхождения человека. Для противодействия Иисусу сатана создает из тьмы и незначительных остатков света женщину, чтобы она раздробила разумную душу человека. Но хоть в женщине и больше тьмы, чем в мужчине, их единство гармонично и неразрывно, подобно янь и инь.
Что касается получаемого человеком откровения о его собственной истинной природе, Мани признает здесь практически все существующие религии и их мессий — Зороастра, Будду, Иисуса, которые выступают вестниками света. Себя же Мани именует «апостолом Иисуса», «окончательным» мессией, объединившим труды предшественников в единственно правильную веру. Рассматривая особенности манихеизма, мы видим, что Мани вполне сознательно брал главные постулаты из канонов наиболее популярных в то время религий. Очевидно, он пытался своими силами сконструировать идеальную религию для всех стран и народов. И действительно, в первое время манихейство проникло практически всюду, от Европы до Китая! Но везде, где бы оно ни появилось, против него тут же настраивались адепты местных церквей, в итоге учение перса Мани получило название «мировая ересь». Ответ на вопрос, почему так случилось, довольно прост. Манихейство было религией просвещения и конкурентоспособной с логической точки зрения. Оно проявило удивительную гибкость — чтило местные традиции и не искало в человеке зло. Такого понятия, как абсолютное зло, в манихеизме просто нет — есть лишь недостаток добра, что опять же сильно роднит учение Мани с буддизмом. Даже самое злое создание может послужить добру. Мани не отрицает и не очерняет старые божества — нет, он лишь корректирует веру. Таким образом, во всех уголках земли люди находили в манихеизме что-то знакомое, даже их боги оставались с ними и только дополнялись Мани. Стоит ли удивляться, что манихейство достигло таких высот?